15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0897 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0897  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  549  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2062  hypothetical protein  42.26 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1169  hypothetical protein  39.27 
 
 
289 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0547046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1363  hypothetical protein  39.55 
 
 
280 aa  185  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.141264  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2244  hypothetical protein  25.69 
 
 
240 aa  95.5  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0810  hypothetical protein  28.52 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2891  hypothetical protein  24.61 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.476006  normal  0.932595 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0853  hypothetical protein  26.14 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2352  hypothetical protein  25.3 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0672053  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0010  hypothetical protein  27.14 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.677214  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2810  hypothetical protein  22.92 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.89476  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1167  hypothetical protein  23.6 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1234  hypothetical protein  27.83 
 
 
298 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3323  hypothetical protein  28.81 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1538  hypothetical protein  28.07 
 
 
308 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>