279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0261 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0261  sigma-54 (RpoN)  100 
 
 
461 aa  936    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3938  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  52.29 
 
 
472 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000403843  normal  0.477567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2992  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  51.07 
 
 
470 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0265  sigma-54 (RpoN)  47.84 
 
 
461 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2020  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  46.57 
 
 
479 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4719  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  49.89 
 
 
467 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00408234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1618  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  46.81 
 
 
453 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2972  RNA polymerase, sigma-54 subunit, RpoN  40.82 
 
 
481 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000649238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1887  RNA polymerase sigma-54 factor  39.92 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0506  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  38.78 
 
 
480 aa  353  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.670024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2755  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  40.32 
 
 
494 aa  346  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378984  normal  0.0333913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1283  sigma-54 (RpoN)  39.38 
 
 
483 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000990086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2166  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  39.5 
 
 
482 aa  345  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3390  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  39 
 
 
515 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0974  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  40.46 
 
 
479 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0869  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  38.8 
 
 
515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4298  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  39.52 
 
 
501 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4320  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  39.52 
 
 
501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4167  sigma-54 (RpoN)  38.92 
 
 
501 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1938  RNA polymerase, sigma 54/sigma 60 factor  40.21 
 
 
485 aa  333  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4312  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  39.52 
 
 
501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.267881 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1505  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  38.81 
 
 
476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132062  hitchhiker  0.000751094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1601  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  39.33 
 
 
474 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.62613 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0427  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  38.09 
 
 
477 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00518389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0974  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  39.57 
 
 
474 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0150  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  38.64 
 
 
475 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15850  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  39.82 
 
 
436 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1771  sigma-54 factor  36.89 
 
 
474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0786495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1303  RNA polymerase factor sigma-54  35.5 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2069  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  38.54 
 
 
488 aa  306  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349645  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3815  RNA polymerase factor sigma-54  37.78 
 
 
477 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.51503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3657  RNA polymerase factor sigma-54  37.73 
 
 
478 aa  302  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0558274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3334  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  36.86 
 
 
510 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1513  RNA polymerase factor sigma-54  35.41 
 
 
461 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3581  RNA polymerase factor sigma-54  37.37 
 
 
477 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3512  RNA polymerase factor sigma-54  37.37 
 
 
477 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3679  RNA polymerase factor sigma-54  37.37 
 
 
477 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.246915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3510  RNA polymerase factor sigma-54  37.37 
 
 
477 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3617  RNA polymerase factor sigma-54  37.37 
 
 
477 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.167296 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0274  RNA polymerase factor sigma-54  36.78 
 
 
477 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0721448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0952  RNA polymerase factor sigma-54  35.56 
 
 
497 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0991  RNA polymerase factor sigma-54  35.56 
 
 
497 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0870  RNA polymerase factor sigma-54  35.07 
 
 
497 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252205  normal  0.87298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03067  DNA-directed RNA polymerase subunit N  36.34 
 
 
477 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0010606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0498  RNA polymerase factor sigma-54  36.34 
 
 
477 aa  289  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128471  normal  0.323836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3568  RNA polymerase factor sigma-54  36.34 
 
 
477 aa  289  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3395  RNA polymerase factor sigma-54  36.34 
 
 
477 aa  289  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4524  RNA polymerase factor sigma-54  36.34 
 
 
477 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3498  RNA polymerase factor sigma-54  36.34 
 
 
477 aa  289  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03018  hypothetical protein  36.34 
 
 
477 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0014618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2650  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  35.66 
 
 
498 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4263  RNA polymerase factor sigma-54  35.67 
 
 
497 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3690  RNA polymerase factor sigma-54  36.34 
 
 
477 aa  289  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0505  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  36.34 
 
 
477 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3638  RNA polymerase factor sigma-54  36.78 
 
 
477 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4367  RNA polymerase factor sigma-54  37.37 
 
 
477 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828271  normal  0.598436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0355  RNA polymerase factor sigma-54  37.2 
 
 
493 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0303  RNA polymerase factor sigma-54  37.88 
 
 
492 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152498  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1153  RNA polymerase factor sigma-54  36.53 
 
 
477 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0441  RNA polymerase factor sigma-54  36.53 
 
 
477 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0959  RNA polymerase factor sigma-54  35.25 
 
 
489 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.742347  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0505  RNA polymerase factor sigma-54  36.53 
 
 
477 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0281  RNA polymerase factor sigma-54  36.78 
 
 
477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0064  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  36.59 
 
 
520 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.353758  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02227  RNA polymerase factor sigma-54  38 
 
 
465 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3685  RNA polymerase factor sigma-54  35.62 
 
 
435 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0408  RNA polymerase factor sigma-54  36.38 
 
 
499 aa  281  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.236863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0741  RNA polymerase factor sigma-54  35.29 
 
 
487 aa  280  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0105  RNA polymerase factor sigma-54  36.65 
 
 
504 aa  279  7e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.768383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5291  RNA polymerase factor sigma-54  36.06 
 
 
435 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57940  RNA polymerase factor sigma-54  35.2 
 
 
497 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0076  RNA polymerase factor sigma-54  35.79 
 
 
513 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5256  RNA polymerase factor sigma-54  35.84 
 
 
435 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.584318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2793  sigma-54, RpoN  34.41 
 
 
482 aa  277  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1514  RNA polymerase factor sigma-54  35.79 
 
 
513 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2418  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  33.67 
 
 
491 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal  0.0433381 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3108  RNA polymerase factor sigma-54  35.79 
 
 
502 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2942  RNA polymerase factor sigma-54  35.79 
 
 
502 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0597  RNA polymerase factor sigma-54  35.79 
 
 
502 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0290  RNA polymerase factor sigma-54  35.7 
 
 
503 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4821  RNA polymerase factor sigma-54  36.06 
 
 
435 aa  276  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0765  RNA polymerase factor sigma-54  35.98 
 
 
513 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0581  RNA polymerase factor sigma-54  35.79 
 
 
502 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5245  RNA polymerase factor sigma-54  35.62 
 
 
435 aa  276  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2715  RNA polymerase factor sigma-54  35.42 
 
 
511 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4831  RNA polymerase factor sigma-54  35.62 
 
 
435 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5227  RNA polymerase factor sigma-54  35.62 
 
 
435 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2226  sigma-54 RpoN  37.74 
 
 
477 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4992  RNA polymerase factor sigma-54  35.62 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5372  RNA polymerase factor sigma-54  35.62 
 
 
435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0159  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  35.11 
 
 
516 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0486  RNA polymerase factor sigma-54  35.39 
 
 
513 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3179  RNA polymerase factor sigma-54  32.81 
 
 
507 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0015  RNA polymerase factor sigma-54  35.35 
 
 
513 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973254  hitchhiker  0.000243165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4453  RNA polymerase sigma-54 factor  32.46 
 
 
497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0370  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  38.02 
 
 
497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3140  RNA polymerase factor sigma-54  40 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0263  RNA polymerase factor sigma-54  35.31 
 
 
503 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2633  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  35.74 
 
 
475 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3025  RNA polymerase sigma-54 factor  35.74 
 
 
475 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>