More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0147 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0147  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  100 
 
 
334 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0172  nifR3 family TIM-barrel protein  55.97 
 
 
319 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000224205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0247  TIM-barrel protein, nifR3 family  55.27 
 
 
322 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0897176  normal  0.676091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2685  nifR3 family TIM-barrel protein  50 
 
 
322 aa  329  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000366446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0110  nifR3 family TIM-barrel protein  48.42 
 
 
318 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000348489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0273  nifR3 family TIM-barrel protein  46.67 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2942  TIM-barrel protein, nifR3 family  46.42 
 
 
320 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0425  NifR3 family TIM-barrel protein  47.68 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0176336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0127  nifR3 family TIM-barrel protein  57.14 
 
 
334 aa  299  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2783  putative dihydrouridine synthase  44.55 
 
 
326 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2469  putative dihydrouridine synthase  44.55 
 
 
326 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00690  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  46.36 
 
 
333 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2083  TIM-barrel protein, nifR3 family  49.07 
 
 
328 aa  291  9e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0161  TIM-barrel protein, nifR3 family  46.25 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0074  TIM-barrel protein, nifR3 family  47.47 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  44.55 
 
 
332 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2788  TIM-barrel protein, nifR3 family  45.71 
 
 
325 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00335838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0914  nifR3 family TIM-barrel protein  43.83 
 
 
347 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1867  TIM-barrel protein, nifR3 family  51.27 
 
 
326 aa  280  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.712125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2807  TIM-barrel protein, nifR3 family  44.1 
 
 
321 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2561  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  45.03 
 
 
324 aa  279  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000534823 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0071  NifR3 family TIM-barrel protein  44.72 
 
 
332 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1403  TIM-barrel protein, nifR3 family  43.48 
 
 
321 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0084  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  44.72 
 
 
332 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000319456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  44.72 
 
 
332 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0071  NifR3 family TIM-barrel protein  44.72 
 
 
332 aa  275  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0074  NifR3 family TIM-barrel protein  44.72 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5233  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  44.41 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.471264  hitchhiker  0.000000472201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0087  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  44.72 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.811614  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1277  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  45.74 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360448  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0083  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  44.41 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1005  dihydrouridine synthase family protein  45.4 
 
 
325 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3909  nifR3 family TIM-barrel protein  46.04 
 
 
348 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329543  normal  0.406839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0075  NifR3 family TIM-barrel protein  44.44 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0075  NifR3 family TIM-barrel protein  44.44 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2560  TIM-barrel protein, nifR3 family  42.51 
 
 
352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl029  tRNA dihydrouridine synthetase  41.18 
 
 
325 aa  263  4e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2184  TIM-barrel protein, nifR3 family  41.46 
 
 
346 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.067096  normal  0.397805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3790  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  44.57 
 
 
352 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0837  tRNA-dihydrouridine synthase  42.16 
 
 
308 aa  259  6e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1650  TIM-barrel protein, nifR3 family  50.32 
 
 
330 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  0.0220296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0661  TIM-barrel protein, nifR3 family  39.76 
 
 
354 aa  258  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.618567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0403  TIM-barrel protein, nifR3 family  41.05 
 
 
358 aa  258  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000189855  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1926  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  42.63 
 
 
351 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0994429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0487  TIM-barrel protein, nifR3 family  45.89 
 
 
353 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2866  nifR3 family TIM-barrel protein  42.9 
 
 
326 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000362833  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2221  tRNA-dihydrouridine synthase  40.67 
 
 
334 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0276  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  41.21 
 
 
354 aa  257  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0245  nifR3 family TIM-barrel protein  44.41 
 
 
333 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2132  TIM-barrel protein, nifR3 family  41.28 
 
 
347 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0025  NifR3 family protein  40.57 
 
 
320 aa  256  4e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4974  TIM-barrel protein, nifR3 family  42.99 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2288  nifR3 family TIM-barrel protein  41.72 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3612  TIM-barrel protein, nifR3 family  40.77 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.807702  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0242  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  39.57 
 
 
348 aa  252  6e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0191961  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0279  tRNA-dihydrouridine synthase  40.3 
 
 
335 aa  252  7e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.690235  hitchhiker  0.007193 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03215  putative TIM-barrel enzyme, possible dehydrogenase  38.97 
 
 
330 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3933  TIM-barrel protein, nifR3 family  46.04 
 
 
348 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1992  dihydrouridine synthase  42.41 
 
 
342 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3847  TIM-barrel protein, nifR3 family  45.75 
 
 
348 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0626  TIM-barrel protein, nifR3 family  36.36 
 
 
326 aa  248  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0112  TIM-barrel protein, nifR3 family  38.51 
 
 
327 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.518902  hitchhiker  0.000116577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3448  nifR3 family TIM-barrel protein  42.59 
 
 
332 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1950  TIM-barrel protein, nifR3 family  42.07 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4632  TIM-barrel protein, nifR3 family  43.48 
 
 
352 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0154  TIM-barrel protein, nifR3 family  41.21 
 
 
351 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.386223  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0231  putative transcriptional regulator  42.15 
 
 
325 aa  243  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2343  TIM-barrel protein, nifR3 family  39.23 
 
 
328 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0479  TIM-barrel protein, nifR3 family  38.68 
 
 
327 aa  242  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0020045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3077  nifR3 family TIM-barrel protein  42.45 
 
 
329 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37590  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  42.33 
 
 
379 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.298865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1810  TIM-barrel protein, nifR3 family  44.03 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752321  hitchhiker  0.00592071 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1825  NifR3/Smm1 family protein  42.41 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3447  TIM-barrel protein, nifR3 family  40.95 
 
 
337 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0429  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  40.49 
 
 
381 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  0.096876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0351  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  39.31 
 
 
343 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.175072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2996  TIM-barrel protein, nifR3 family  37.35 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0360  NifR3 family TIM-barrel protein  37.2 
 
 
329 aa  238  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2731  NifR3 family TIM-barrel protein  39.75 
 
 
333 aa  238  9e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00411092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03937  tRNA-dihydrouridine synthase B  39.18 
 
 
332 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259416  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0818  hypothetical protein  39.38 
 
 
327 aa  237  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.540115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1563  NifR3 family TIM-barrel protein  42.59 
 
 
356 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.526458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2070  nifR3 family TIM-barrel protein  44.34 
 
 
349 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0124103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0489  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  40.43 
 
 
356 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6811  TIM-barrel protein, nifR3 family  41.64 
 
 
393 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.394979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1325  nifR3 family TIM-barrel protein  40.13 
 
 
334 aa  236  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.544118  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3670  nifR3 family TIM-barrel protein  41.42 
 
 
336 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0382  TIM-barrel protein, nifR3 family  40.5 
 
 
355 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0645  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  41.64 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.446085  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3365  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  40.95 
 
 
388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815066  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2181  TIM-barrel protein, nifR3 family  43.12 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.14819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2909  TIM-barrel protein, nifR3 family  41.43 
 
 
353 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0397  TIM-barrel protein, nifR3 family  40.19 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1813  nifR3 family TIM-barrel protein  43.28 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2392  TIM-barrel protein, nifR3 family  37.07 
 
 
329 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226575  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3586  nifR3 family TIM-barrel protein  41.43 
 
 
353 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.459705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2551  NifR3 family TIM-barrel protein  39.51 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.344775  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0894  nifR3 family TIM-barrel protein  40.56 
 
 
353 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3779  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  40.37 
 
 
355 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0758  putative tRNA-dihydrouridine synthase  37.42 
 
 
317 aa  232  6e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.164456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>