72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8519 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8519  protein of unknown function DUF485  100 
 
 
89 aa  173  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  42.5 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2495  protein of unknown function DUF485  44.74 
 
 
128 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2786  protein of unknown function DUF485  38.54 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991067  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2563  hypothetical protein  38.54 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  40.51 
 
 
101 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6217  hypothetical protein  43.08 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2261  hypothetical protein  43.08 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105984  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2886  hypothetical protein  43.08 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696327  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2875  hypothetical protein  43.08 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  42.65 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3141  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3878  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  34.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  34.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2792  hypothetical protein  41.54 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14797  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  34.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  34.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  36.25 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  34.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  34.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  34.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  34.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2930  hypothetical protein  41.54 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462047  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  42.19 
 
 
102 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  34.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  37.5 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  35 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  35 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3159  protein of unknown function DUF485  37.08 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  38.71 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  45 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0638  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3230  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  36.07 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0454  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1387  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0474  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585175  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  31.08 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2813  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0428  hypothetical protein  44.62 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0206  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0397  hypothetical protein  38.46 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  33.75 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0985  hypothetical protein  38.1 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  35.59 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  32.35 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0314  protein of unknown function DUF485  39.39 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  40.68 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  36.51 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  32.88 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  34.78 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  35.94 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  41.54 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0275  hypothetical protein  36.49 
 
 
104 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279354  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  33.82 
 
 
103 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1455  hypothetical protein  28.75 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  33.82 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  37.04 
 
 
666 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  33.78 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>