209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8072 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8072  fusaric acid resistance protein FusE  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  30.57 
 
 		 376 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  29.53 
 
 		 376 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  29.84 
 
 		 376 aa  90.5  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.98 
 
 		 376 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  30.73 
 
 		 378 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  30.21 
 
 		 378 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  28.65 
 
 		 378 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  28.65 
 
 		 378 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  28.65 
 
 		 378 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  28.65 
 
 		 378 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  28.65 
 
 		 378 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  29.59 
 
 		 378 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.65 
 
 		 378 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  30.21 
 
 		 378 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  30.21 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  30.21 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  30.21 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.21 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  30.21 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  28.65 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  32.29 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  30.21 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  30.21 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  30.21 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  30.48 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  29.69 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  28.5 
 
 		 381 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  27.98 
 
 		 378 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 381 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 381 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 381 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 381 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  30.26 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  28.19 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  27.98 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 		 361 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  30.11 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  29.57 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 368 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 383 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  27.46 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  29.03 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  31.74 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  28.65 
 
 		 381 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  29.61 
 
 		 368 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  29.95 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  30.29 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  29.85 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  30.46 
 
 		 366 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  33.5 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  30.46 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  30.92 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 356 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 352 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  30.26 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  26.49 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  28.3 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  32.26 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  27.81 
 
 		 381 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  27.53 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  27.53 
 
 		 352 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  33.62 
 
 		 352 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  26.26 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  33.62 
 
 		 352 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  26.2 
 
 		 368 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 		 334 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  27.33 
 
 		 346 aa  52  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  30.66 
 
 		 368 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  26.19 
 
 		 287 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  30.66 
 
 		 368 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 285 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  26.19 
 
 		 287 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  26.19 
 
 		 287 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 		 375 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  32.17 
 
 		 357 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  26.88 
 
 		 354 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  25.45 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  25.45 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  26.74 
 
 		 378 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 		 352 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 		 352 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  25.45 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  25.45 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  28.39 
 
 		 395 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  31.47 
 
 		 344 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  29.63 
 
 		 314 aa  48.5  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.55 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>