22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5904 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5904  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188041  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3299  hypothetical protein  37.28 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3622  hypothetical protein  37.57 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.453951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5306  hypothetical protein  91.07 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3499  hypothetical protein  55.07 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2056  hypothetical protein  29.01 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.79 
 
 		 2449 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2228  hypothetical protein  26.6 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00178512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4496  hypothetical protein  58.49 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1675  hypothetical protein  39.74 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1773  hypothetical protein  35.42 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185989  decreased coverage  0.00548408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1939  hypothetical protein  38.2 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0577581  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.66 
 
 		 1888 aa  54.3  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1645  hypothetical protein  45.76 
 
 		 393 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2628  hypothetical protein  26.16 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.460391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 		 3521 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  26.35 
 
 		 3409 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3520  hypothetical protein  35.29 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  27.44 
 
 		 3472 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  26.67 
 
 		 3471 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3320  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3041  hypothetical protein  37.04 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>