77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4885 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4885  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 		 357 aa  726    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.635672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3460  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  87.05 
 
 		 359 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.540245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0675  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  80.36 
 
 		 370 aa  547  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.329343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19500  hypothetical protein  24.35 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  24.35 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2224  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  26.27 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4036  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.07 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4331  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.27 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.07 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0498257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0544  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.12 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.97989  normal  0.846557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2516  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.88 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445481  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3294  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.88 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6753  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.25 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0691662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6519  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.25 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7503  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, aliphatic sulphonates  26.35 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.25 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  22.9 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  23.79 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4154  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  32.08 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7198  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  31.11 
 
 		 357 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.15 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  22.83 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  22.83 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3815  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  30.68 
 
 		 308 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  22.83 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.49 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.58 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.49 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  22.83 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  24.83 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.68 
 
 		 331 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0774  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.94 
 
 		 316 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0489455 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5469  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  26.95 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5064  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.97 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133964  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0454  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.35 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1370  ABC transporter substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.68 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2848  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  23.81 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1051  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.59 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.588314  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0334  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.43 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  30.06 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1045  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  23.59 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2382  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  23.59 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3137  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.27 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0381  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.43 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.996496 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00947  hypothetical protein  23.59 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.525571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2183  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  23.59 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.680381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00940  alkanesulfonate transporter subunit  23.59 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1152  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.64 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.12 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5003  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.48 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00833657  normal  0.452376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1644  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.24 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.789892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3087  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.78 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0286269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2660  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  24.88 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.536053  normal  0.0112507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2707  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  24.88 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.23 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4340  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.88 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4021  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.14 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391639  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7798  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate- binding protein SsuA  25.27 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5002  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.27 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016963  normal  0.417754 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  25.1 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  27.78 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.09 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1469  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.43 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.12 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.71 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4250  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.82 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125058  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4116  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.82 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4146  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.23 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287587  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3267  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.82 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1779  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.5 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3439  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  23.39 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5471  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  26.16 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2420  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.49 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1977  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.95 
 
 		 351 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>