86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2941 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2941  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 117 aa  221  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3821  transcriptional regulator, XRE family  94.02 
 
 		 117 aa  173  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4232  transcriptional regulator, XRE family  90.6 
 
 		 117 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  32.18 
 
 		 312 aa  47  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 397 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 397 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4074  hypothetical protein  55.81 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 383 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  29.29 
 
 		 308 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.13 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 428 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  32.65 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3628  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0172593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  38.98 
 
 		 480 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 480 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 482 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 481 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 480 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01337  phage-related protei  35.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 504 aa  42  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  36.76 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26490  Helix-turn-helix protein  62.5 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  38.18 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  36.76 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 483 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  32.38 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 504 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 483 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2246  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 117 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2606  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 478 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  28 
 
 		 302 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.62 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  38.18 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  34.48 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  38.18 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  41.54 
 
 		 428 aa  40.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1831  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  37.66 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 368 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  34.48 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  34.48 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  36.7 
 
 		 431 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  34.48 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 277 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2619  XRE family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000698613  hitchhiker  0.000000000219561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2585  XRE family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00026111  hitchhiker  0.00000611184 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  28.81 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  31.88 
 
 		 369 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  31.43 
 
 		 240 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1907  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  30 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  31.43 
 
 		 240 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  40.58 
 
 		 227 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0249  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  36 
 
 		 236 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 812 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3720  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0580307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 495 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  42.11 
 
 		 301 aa  40.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 488 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 213 aa  40.4  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  28.81 
 
 		 223 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9533  transcriptional regulator Cro/CI family  30.69 
 
 		 141 aa  40  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3790  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 75 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 289 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 104 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>