More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_R0012 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_R0007  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000589313  hitchhiker  0.000462971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00686442  normal  0.0133226 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0051  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00938855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0096  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0060738  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0017  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4845  tRNA-Ile  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0555625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t03  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t09  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0116209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t15  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t42  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t63  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.07883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA14  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0900551  normal  0.0100999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA5  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174877  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA51  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000929539  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA73  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00020083  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA82  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000191187  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R13  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000158888  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R2  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567165  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R42  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533032  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R59  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000380652  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R80  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887019  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R93  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000022565  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5402  tRNA-Ile  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0831781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6152  tRNA-Ile  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0002  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000811561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0012  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000226616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0056  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00138336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0078  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000836991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0086  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00068353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0812  tRNA-Ile  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0059  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000552358  normal  0.693628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0007  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00099613  hitchhiker  0.000158126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0014  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192391  hitchhiker  0.00313386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0032  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000276963  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0092  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368423  hitchhiker  0.00436649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0063  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000331537  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0010  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000315774  hitchhiker  0.000925503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0073  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000465984  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0081  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00202745  normal  0.185006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0005  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000179229  normal  0.648072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0022  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000998833  hitchhiker  0.000594977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0009  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0460221  hitchhiker  0.00205125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0055  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.290237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0098  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000369381  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0079  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000309524  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0035  tRNA-Ile  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000956793  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t09  tRNA-Ile  97.18 
 
 
74 bp  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630661  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t48  tRNA-Ile  97.18 
 
 
74 bp  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t70  tRNA-Ile  97.18 
 
 
74 bp  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619158  hitchhiker  0.00932375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60000  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0181661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60090  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60160  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000736838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60340  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0530046  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60380  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0553441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60550  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000429447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08580  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55635  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.269622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62080  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0500428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70900  tRNA-Ile  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.335626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000489104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000626175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000696824  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1916  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000828574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0276  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.66107e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0002  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0014  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0031  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0035  tRNA-Ile  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1610  tRNA-Ile  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3075t  tRNA-Ile  96.77 
 
 
74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3111t  tRNA-Ile  96.77 
 
 
74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0032  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000441039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0058  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00171421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0017  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000136136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0005  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0474299  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0010  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121367  normal  0.0933113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0007  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000593812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0014  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4265  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000229393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4204  tRNA-Ile  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt40  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt40  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0033  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.715295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0043  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.333285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0052  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.307306  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0020  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0045  tRNA-Ile  93.85 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000457584  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0060  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0050  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0071  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.207153  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0020  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0041  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0003  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000253245  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0046  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000007266  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0028  tRNA-Ile  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  hitchhiker  0.002006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>