More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1929 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1929  pseudouridine synthase Rlu family protein  100 
 
 		 223 aa  464  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.975546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1363  pseudouridine synthase Rlu family protein  48.21 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0099  pseudouridine synthase Rlu family protein  49.11 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000500513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1142  RNA psedouridine synthase  45.5 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1328  pseudouridine synthase RluA-like  45.7 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3536  pseudouridine synthase RluA-like protein  49.78 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4080  pseudouridine synthase Rlu family protein  47.95 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4781  pseudouridine synthase Rlu family protein  45.58 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  unclonable  0.0000000101532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0300  pseudouridine synthase Rlu family protein, TIGR01621  45.06 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0295  pseudouridine synthase Rlu family protein  45.06 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.859464  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1273  pseudouridine synthase Rlu family protein  43.91 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0092  pseudouridine synthase Rlu family protein  46.22 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.752208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0296  pseudouridine synthase Rlu family protein  45.06 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4390  pseudouridine synthase Rlu family protein  44.1 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0288  pseudouridine synthase Rlu family protein  45.06 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4108  pseudouridine synthase Rlu family protein  48.26 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0399  pseudouridine synthase Rlu family protein  44.87 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0325553  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1318  pseudouridine synthase Rlu family protein  44.44 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1914  copper-resistance protein CopA  48.28 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.290092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0284  pseudouridine synthase Rlu family protein  43.78 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000244017  hitchhiker  0.0000000309962 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003802  pseudouridylate synthase LSU rRNA-specific  44.78 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1290  pseudouridine synthase Rlu family protein, TIGR01621  43.3 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0111  pseudouridine synthase RluA-like protein  47.29 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0283  pseudouridine synthase Rlu family protein  43.16 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02690  hypothetical protein  43.04 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3738  pseudouridine synthase Rlu family protein  42.74 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.605712  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_10480  predicted protein  48.04 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00789821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3245  pseudouridine synthase  38.67 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02767  tRNA pseudouridine synthase A  41.28 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1374  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.13 
 
 		 543 aa  95.9  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0565  RluA family pseudouridine synthase  33 
 
 		 306 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.789528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2576  RNA pseudouridylate synthase family protein  33.96 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.19 
 
 		 307 aa  92.4  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  32.46 
 
 		 560 aa  91.7  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0023  putative ribosomal pseudouridine synthase  33.64 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.835317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0447  pseudouridylate synthase  31.14 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  35.53 
 
 		 305 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.67 
 
 		 316 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2574  pseudouridine synthase, RluA family  34.12 
 
 		 315 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0131416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  34.62 
 
 		 299 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.99 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1413  pseudouridine synthase, RluA family  28.95 
 
 		 293 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3296  pseudouridine synthase  31.63 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5337  pseudouridine synthase  32.63 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.588803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48756  predicted protein  34.04 
 
 		 383 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0290752  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  30.81 
 
 		 307 aa  86.3  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  34.17 
 
 		 346 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0390  RluA family pseudouridine synthase  31.38 
 
 		 339 aa  85.9  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1955  tRNA pseudouridine synthase C  35.03 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419985 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2414  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  32.58 
 
 		 290 aa  85.9  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0375  RluA family pseudouridine synthase  29.95 
 
 		 299 aa  85.9  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000429003  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  29.65 
 
 		 310 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  29.59 
 
 		 325 aa  85.1  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3345  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.46 
 
 		 333 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1206  RNA pseudouridylate synthase  31.96 
 
 		 307 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.575901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1382  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  31.96 
 
 		 307 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.53631 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1304  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  31.96 
 
 		 307 aa  84.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1043  pseudouridine synthase  33.16 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2278  tRNA pseudouridine synthase C  32.39 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0554113  hitchhiker  0.00000285246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2659  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.68 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1649  RluA family pseudouridine synthase  30.56 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1405  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.96 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0207  pseudouridine synthase, RluA family  34.39 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11573  pseudouridylate synthase  33 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1883  pseudouridine synthase  34.27 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  32.39 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3092  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.598347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3178  pseudouridine synthase, RluA family  36.84 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3152  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2627  pseudouridine synthase, RluA family  31.46 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  33.51 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1184  ribosomal large subunit pseudouridylate synthase D  31.44 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1044  pseudouridine synthase, RluA family  32.11 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  31.06 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0047  pseudouridine synthase, RluD  32.11 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.63 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  36.04 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.09 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2722  pseudouridine synthase  30.69 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6848  RluA family pseudouridine synthase  34.24 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0176  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  29.69 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.44 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  36.26 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0584  RluA family pseudouridine synthase  30.89 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.460121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2950  RluA family pseudouridine synthase  31.07 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.39 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  30.7 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  33.99 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  34.01 
 
 		 305 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1813  pseudouridine synthase, RluA family  32.83 
 
 		 526 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000964916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1446  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  31.44 
 
 		 307 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2774  RluA family pseudouridine synthase  32 
 
 		 309 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.538883  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1005  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 343 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0303  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.74 
 
 		 308 aa  81.6  0.000000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00443703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3639  RluA family pseudouridine synthase  31.5 
 
 		 309 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.323041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0212  RluA family pseudouridine synthase  34.74 
 
 		 298 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.935896  normal  0.204158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1014  RluA family pseudouridine synthase  31.96 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1745  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.98 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0397  pseudouridine synthase, RluA family  31.03 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>