More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0302 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0302  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2037  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 227 aa  245  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0662  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 236 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00302199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0890  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 242 aa  242  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000284562  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 241 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  45.66 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  43.75 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  42.08 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0016  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 262 aa  185  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  43.24 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4110  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0109  response regulator receiver  39.82 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000662688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2409  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.615174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.72 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2907  winged helix family two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00514074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2784  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  40.91 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2876  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.5251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.99 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0274  DNA-binding response regulator  40.54 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0281  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000001543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3740  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0282  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.919503  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2085  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6011  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2066  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4428  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  40.45 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  40.91 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.45 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.28 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.18 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.45 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.64 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  37.16 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  39.82 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.27 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 258 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  40.27 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1972  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.55 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  39.55 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.55 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.55 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.64 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  37.22 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3127  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.64 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.674952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>