11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4671 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4671  PPE family protein  100 
 
 
382 aa  737    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535687  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4757  PPE family protein  100 
 
 
382 aa  737    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5056  PPE family protein  99.21 
 
 
382 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1757  PPE family protein  43.02 
 
 
183 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  45.71 
 
 
436 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  42.59 
 
 
439 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  49.29 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  46.9 
 
 
443 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  46.9 
 
 
443 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  42.35 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  47.37 
 
 
450 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>