18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3713 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3713  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  33.33 
 
 
154 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  26.27 
 
 
131 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0986  hypothetical protein  28.41 
 
 
236 aa  48.5  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0388198  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0638  hypothetical protein  22.14 
 
 
189 aa  48.5  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000264221  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0511  protein of unknown function DUF302  27.05 
 
 
214 aa  48.5  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000589231  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0450  hypothetical protein  23.13 
 
 
189 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  27.93 
 
 
135 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1748  protein of unknown function DUF302  28.17 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221379  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0268  hypothetical protein  30.38 
 
 
301 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000114097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  26.83 
 
 
135 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  27.71 
 
 
132 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  28.41 
 
 
131 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  26.88 
 
 
136 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  23.26 
 
 
127 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  26.25 
 
 
131 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>