More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2197 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2197  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
649 aa  1308    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0987454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1563  preprotein translocase subunit SecA  41.49 
 
 
662 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1343  preprotein translocase subunit SecA  44.62 
 
 
663 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0620  preprotein translocase subunit SecA  42.03 
 
 
668 aa  415  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  38.35 
 
 
837 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  38.03 
 
 
837 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  37.2 
 
 
836 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2357  preprotein translocase subunit SecA  41.18 
 
 
685 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.543431  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2398  preprotein translocase subunit SecA  41.82 
 
 
678 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  36.07 
 
 
835 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0365  protein translocase subunit secA  36.2 
 
 
787 aa  382  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  36.07 
 
 
835 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  36.07 
 
 
835 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  36.07 
 
 
835 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  35.91 
 
 
835 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  38.07 
 
 
796 aa  379  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  36.07 
 
 
835 aa  379  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  35.91 
 
 
835 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0924  preprotein translocase subunit SecA  36.74 
 
 
666 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  35.91 
 
 
835 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  33.95 
 
 
848 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  35.75 
 
 
835 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  36.25 
 
 
787 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  35.59 
 
 
835 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1687  preprotein translocase subunit SecA  36.55 
 
 
842 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0183  protein translocase subunit secA  35.79 
 
 
803 aa  371  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  36.28 
 
 
859 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  36.39 
 
 
844 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  37.63 
 
 
864 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  36.61 
 
 
845 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  36.26 
 
 
849 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  36.24 
 
 
830 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  35.55 
 
 
865 aa  365  1e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  36.58 
 
 
843 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  37 
 
 
833 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  36.93 
 
 
834 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0794  preprotein translocase subunit SecA  36.58 
 
 
843 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  34.63 
 
 
884 aa  364  2e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  34.38 
 
 
845 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2175  preprotein translocase subunit SecA  40.06 
 
 
658 aa  363  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.407443  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  36.25 
 
 
824 aa  363  6e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  34.28 
 
 
840 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  36.01 
 
 
888 aa  360  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  34.9 
 
 
886 aa  359  9e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3262  preprotein translocase subunit SecA  39.53 
 
 
797 aa  359  9e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  37.57 
 
 
844 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  34.19 
 
 
863 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  34.41 
 
 
858 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  37.15 
 
 
836 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  36.93 
 
 
838 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  35.87 
 
 
799 aa  356  5.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3807  preprotein translocase, SecA subunit  34.76 
 
 
895 aa  356  7.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0963816  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  33.82 
 
 
855 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3049  preprotein translocase subunit SecA  38.68 
 
 
787 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  35.73 
 
 
903 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  35.23 
 
 
868 aa  353  5e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  36.22 
 
 
840 aa  353  5.9999999999999994e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  38.12 
 
 
858 aa  353  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  35.55 
 
 
916 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  35.19 
 
 
902 aa  352  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0589  preprotein translocase subunit SecA  33.49 
 
 
853 aa  351  2e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  34.27 
 
 
862 aa  351  3e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  35.39 
 
 
916 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  34.1 
 
 
862 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0194  preprotein translocase subunit SecA  33.28 
 
 
931 aa  348  1e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0232  preprotein translocase, SecA subunit  33.49 
 
 
804 aa  349  1e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  33.38 
 
 
954 aa  349  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  35.09 
 
 
871 aa  348  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  34.6 
 
 
911 aa  348  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  34.96 
 
 
869 aa  347  3e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1214  preprotein translocase subunit SecA  35.09 
 
 
871 aa  347  4e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480114  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  33.99 
 
 
862 aa  347  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0711  preprotein translocase subunit SecA  36.44 
 
 
787 aa  346  7e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.752674  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20600  protein translocase subunit secA  35.04 
 
 
985 aa  345  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.648191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1321  protein translocase subunit secA  34.05 
 
 
788 aa  345  2e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  32.65 
 
 
857 aa  343  5.999999999999999e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1061  preprotein translocase subunit SecA  34.3 
 
 
788 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000383291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0786  preprotein translocase subunit SecA  34.3 
 
 
788 aa  343  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0971  preprotein translocase subunit SecA  34.14 
 
 
788 aa  343  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  32.87 
 
 
866 aa  343  8e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  34.97 
 
 
897 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0838  preprotein translocase subunit SecA  34.14 
 
 
788 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0882  preprotein translocase subunit SecA  34.14 
 
 
788 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  33.87 
 
 
921 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  35.11 
 
 
915 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1313  preprotein translocase subunit SecA  32.78 
 
 
864 aa  341  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  35.53 
 
 
859 aa  340  5e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  33.83 
 
 
931 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  33.83 
 
 
931 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  34.98 
 
 
917 aa  340  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  33.08 
 
 
894 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  33.83 
 
 
931 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  33.83 
 
 
931 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  33.83 
 
 
931 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  33.83 
 
 
931 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  34.88 
 
 
1009 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  33.83 
 
 
931 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  34.38 
 
 
992 aa  339  7e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  35.84 
 
 
896 aa  339  8e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  33.33 
 
 
910 aa  339  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>