More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2175 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2175  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 658 aa  1351    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.407443  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0620  preprotein translocase subunit SecA  47.98 
 
 		 668 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0924  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 		 666 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1343  preprotein translocase subunit SecA  46.27 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2398  preprotein translocase subunit SecA  46.78 
 
 		 678 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2357  preprotein translocase subunit SecA  45.77 
 
 		 685 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.543431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  45.23 
 
 		 796 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  43.2 
 
 		 864 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  43.03 
 
 		 858 aa  422  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  40.52 
 
 		 896 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  40.52 
 
 		 896 aa  418  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  44.68 
 
 		 859 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  43.38 
 
 		 787 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  39.9 
 
 		 897 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  41.07 
 
 		 836 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  42.15 
 
 		 833 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1563  preprotein translocase subunit SecA  42.17 
 
 		 662 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  40.92 
 
 		 917 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  44.57 
 
 		 838 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  44.25 
 
 		 844 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  43.17 
 
 		 837 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3928  preprotein translocase subunit SecA  42.02 
 
 		 917 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12275  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3049  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 787 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  42.91 
 
 		 868 aa  402  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  40.83 
 
 		 921 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  40.92 
 
 		 917 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0711  preprotein translocase subunit SecA  42.26 
 
 		 787 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.752674  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  42.98 
 
 		 920 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 		 931 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  41.4 
 
 		 862 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 		 931 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  43.09 
 
 		 923 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 		 931 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 		 931 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  38.62 
 
 		 899 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 		 931 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  43.17 
 
 		 837 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 		 931 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  41.73 
 
 		 866 aa  399  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  42.12 
 
 		 934 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2761  preprotein translocase subunit SecA  38.51 
 
 		 906 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 		 931 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  40.77 
 
 		 859 aa  402  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  39.49 
 
 		 896 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  43.54 
 
 		 842 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  41.21 
 
 		 862 aa  398  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  42.12 
 
 		 934 aa  399  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  38.35 
 
 		 908 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  42.53 
 
 		 913 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  38.6 
 
 		 894 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0365  protein translocase subunit secA  40.64 
 
 		 787 aa  398  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  43.22 
 
 		 903 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  38.51 
 
 		 908 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  40.67 
 
 		 909 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  39.54 
 
 		 910 aa  398  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  40.32 
 
 		 932 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  42.53 
 
 		 916 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  42.15 
 
 		 932 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  41.76 
 
 		 886 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  39.53 
 
 		 908 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  41.39 
 
 		 910 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  40.03 
 
 		 907 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  41.21 
 
 		 862 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  40.32 
 
 		 932 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  41.15 
 
 		 914 aa  399  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  41.75 
 
 		 901 aa  399  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  40.99 
 
 		 899 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  39.93 
 
 		 922 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  39.36 
 
 		 907 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  44.35 
 
 		 836 aa  395  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  39.9 
 
 		 835 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  39.74 
 
 		 835 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  41.94 
 
 		 863 aa  394  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  39.74 
 
 		 835 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  40.24 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  39.74 
 
 		 835 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  41.03 
 
 		 869 aa  395  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 932 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  39.74 
 
 		 835 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 		 930 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  41.68 
 
 		 912 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  40.81 
 
 		 914 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  40.24 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  41.75 
 
 		 895 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  40.16 
 
 		 932 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  40.74 
 
 		 840 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  40.74 
 
 		 845 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  40.92 
 
 		 909 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  40.24 
 
 		 908 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  39.9 
 
 		 835 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  42.22 
 
 		 845 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  40.24 
 
 		 911 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  40.65 
 
 		 855 aa  394  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5307  preprotein translocase subunit SecA  39.74 
 
 		 835 aa  392  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  39.58 
 
 		 835 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  39.26 
 
 		 907 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  39.87 
 
 		 907 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  41.8 
 
 		 931 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  42.33 
 
 		 936 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5650  preprotein translocase subunit SecA  39.58 
 
 		 835 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000356308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>