127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0956 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0956  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
602 aa  1215    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  24.54 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  22.05 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  22.71 
 
 
320 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  23.83 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  24.72 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  24.72 
 
 
563 aa  67  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  23.55 
 
 
393 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 
564 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  24.74 
 
 
437 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.21 
 
 
562 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.21 
 
 
562 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  27.8 
 
 
279 aa  63.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  25.42 
 
 
291 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.21 
 
 
562 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.48 
 
 
562 aa  63.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  22.51 
 
 
364 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  21.96 
 
 
542 aa  60.8  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  27.31 
 
 
300 aa  60.8  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.54 
 
 
562 aa  60.8  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1681  AAA ATPase  25.32 
 
 
266 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.03 
 
 
559 aa  60.8  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  24.68 
 
 
341 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0311  AAA ATPase  25.32 
 
 
266 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  25.48 
 
 
395 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  24.58 
 
 
266 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  24.58 
 
 
266 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0329  AAA ATPase  24.47 
 
 
266 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.45 
 
 
589 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.5 
 
 
580 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  24.42 
 
 
831 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  22.07 
 
 
302 aa  59.3  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  23.6 
 
 
538 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  24.58 
 
 
266 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  24.17 
 
 
536 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  24.26 
 
 
554 aa  58.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  22.14 
 
 
498 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  23.5 
 
 
577 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.21 
 
 
568 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  25.19 
 
 
390 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1683  AAA ATPase  24.58 
 
 
266 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  21.4 
 
 
505 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  24.58 
 
 
266 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  22.27 
 
 
541 aa  57.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  23.75 
 
 
536 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  23.41 
 
 
414 aa  57.4  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  25.21 
 
 
308 aa  57.4  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  22.81 
 
 
300 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.61 
 
 
572 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  25.25 
 
 
447 aa  56.2  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  24.79 
 
 
557 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  23.87 
 
 
532 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  25.29 
 
 
540 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  24.46 
 
 
302 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.79 
 
 
557 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.83 
 
 
536 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  23.9 
 
 
532 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.79 
 
 
557 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.79 
 
 
557 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  21.62 
 
 
296 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.98 
 
 
538 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  24.3 
 
 
314 aa  54.3  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  22.49 
 
 
302 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  21.74 
 
 
318 aa  53.9  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  22.49 
 
 
302 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  22.49 
 
 
302 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  22.49 
 
 
302 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  22.61 
 
 
301 aa  53.9  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  22.54 
 
 
282 aa  53.9  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  23.15 
 
 
368 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.75 
 
 
557 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  22.61 
 
 
740 aa  53.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.93 
 
 
587 aa  53.5  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.55 
 
 
541 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  23.86 
 
 
306 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  24.14 
 
 
422 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  23.86 
 
 
306 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.95 
 
 
556 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  21.12 
 
 
563 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  26.56 
 
 
570 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  22.31 
 
 
261 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  23.86 
 
 
305 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  22.03 
 
 
304 aa  51.6  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  19.92 
 
 
357 aa  51.6  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.55 
 
 
558 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  21.53 
 
 
303 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  21.22 
 
 
346 aa  51.2  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  24.88 
 
 
271 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  22.76 
 
 
261 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1803  phage tail X family protein  26.16 
 
 
586 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  22.38 
 
 
302 aa  50.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  21.81 
 
 
392 aa  50.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  21.19 
 
 
388 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  23 
 
 
310 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2231  AAA ATPase  23.11 
 
 
927 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.692531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  23.66 
 
 
334 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  25.21 
 
 
341 aa  50.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  23.36 
 
 
310 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  23.47 
 
 
309 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  23.47 
 
 
309 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>