34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0658 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1260  30S ribosomal protein S14P  100 
 
 		 53 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0658  30S ribosomal protein S14P  100 
 
 		 53 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0165  30S ribosomal protein S14P  98.11 
 
 		 53 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000451601  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0724  30S ribosomal protein S14P  94.34 
 
 		 53 aa  102  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1398  30S ribosomal protein S14P  75.47 
 
 		 53 aa  89.4  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1714  ribosomal protein S14  62.5 
 
 		 47 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0015  30S ribosomal protein S14P  56.6 
 
 		 50 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.67188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2010  30S ribosomal protein S14P  60.78 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.866444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0241  30S ribosomal protein S14P  61.22 
 
 		 54 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1258  30S ribosomal protein S14P  56.86 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1764  ribosomal protein S14  56 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.351928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0096  30S ribosomal protein S14P  60 
 
 		 50 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000254546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1842  ribosomal protein S14  61.22 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0578  ribosomal protein S14  60 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1507  ribosomal protein S14  65.96 
 
 		 53 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.59133e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0177  30S ribosomal protein S14P  56.86 
 
 		 54 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1864  30S ribosomal protein S14P  54.9 
 
 		 54 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31044  RPS29A; ribosomal protein S29A (S36A) (YS29)  56.82 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167387  normal  0.57563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2239  30S ribosomal protein S14P  59.09 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000503282  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2232  ribosomal protein S14  61.54 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0224  ribosomal protein S14  64.86 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0095  30S ribosomal protein S14P  51.06 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450951 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0796  30S ribosomal protein S14  55.56 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.250712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0546  30S ribosomal protein S14P  54.55 
 
 		 51 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355723  normal  0.314336 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11411  40S ribosomal protein S29 (Eurofung)  52.27 
 
 		 56 aa  52  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0456  30S ribosomal protein S14P  53.19 
 
 		 51 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0105  30S ribosomal protein S14P  53.06 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000005595  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2435  30S ribosomal protein S14P  45.83 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42310  Ribosomal protein S29, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  52.27 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.243143  normal  0.393966 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28147  predicted protein  51.11 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2306  30S ribosomal protein S14P  52.63 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1842  ribosomal protein S14  53.85 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4131  ribosomal protein S14  51.28 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43539  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04290  conserved hypothetical protein  48.89 
 
 		 54 aa  44.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.546532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>