22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1750 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1750  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  393  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0152  hypothetical protein  92.71 
 
 
192 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.488575  normal  0.0139746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0712  hypothetical protein  90.1 
 
 
196 aa  344  5e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0016  hypothetical protein  73.02 
 
 
189 aa  296  8e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0726  hypothetical protein  57.07 
 
 
198 aa  227  9e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.655013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1389  Protein of unknown function DUF1867  47.57 
 
 
181 aa  167  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000416753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1252  hypothetical protein  44.51 
 
 
185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086966 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0042  hypothetical protein  42.86 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0042  hypothetical protein  42.31 
 
 
185 aa  158  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.175316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2514  hypothetical protein  40.64 
 
 
184 aa  153  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.235466  normal  0.0113167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1576  hypothetical protein  41.88 
 
 
196 aa  151  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1724  hypothetical protein  41.88 
 
 
196 aa  151  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1177  hypothetical protein  40.21 
 
 
185 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2132  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.713165  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0708  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.117137  normal  0.791979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2622  hypothetical protein  38.1 
 
 
196 aa  130  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0927  hypothetical protein  40.1 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1087  hypothetical protein  42.41 
 
 
195 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2076  Protein of unknown function DUF1867  41.21 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1128  hypothetical protein  36.32 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0266635  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1542  hypothetical protein  33.53 
 
 
255 aa  92.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0888  putative cytoplasmic protein  31.15 
 
 
196 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>