13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0603 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0603  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  254  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.280022  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1777  hypothetical protein  96 
 
 
125 aa  247  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.957484  hitchhiker  0.000266375 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0763  hypothetical protein  94.4 
 
 
125 aa  245  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0453  hypothetical protein  94.4 
 
 
125 aa  240  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00079695  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1133  hypothetical protein  92.8 
 
 
125 aa  238  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0778529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0432  hypothetical protein  92 
 
 
125 aa  236  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.568136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0111  hypothetical protein  88.8 
 
 
125 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1194  hypothetical protein  90.2 
 
 
107 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.919589 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0415  hypothetical protein  92.94 
 
 
100 aa  169  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0059  hypothetical protein  53.33 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.222888  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0001  hypothetical protein  53.33 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00209725  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1475  hypothetical protein  52.38 
 
 
108 aa  107  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0541849 
 
 
-
 
NC_009136  MmarC5_1843  hypothetical protein  43 
 
 
184 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>