18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2085 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2085  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  248  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.975572  normal  0.306975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1044  hypothetical protein  38.64 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3478  hypothetical protein  30.4 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2414  hypothetical protein  32.22 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1272  hypothetical protein  35.23 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0957  secreted (periplasmic) protein-like  29.21 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5103  hypothetical protein  36.08 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4640  hypothetical protein  36.08 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0336468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5179  putative exported protein of unknown function  36.08 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2364  hypothetical protein  35.96 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4055  hypothetical protein  33.71 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0047292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6181  hypothetical protein  30.68 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.356695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5470  hypothetical protein  34.02 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0262  hypothetical protein  32.26 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.0475233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1851  hypothetical protein  30.34 
 
 
203 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2187  hypothetical protein  34.74 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0734029  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0954  hypothetical protein  28.57 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1987  hypothetical protein  28.09 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>