24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0671 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0671  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2176  flagellar export protein FliJ  40 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1824  flagellar export protein FliJ  40.74 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00891428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3910  flagellar export FliJ  39.26 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4231  flagellar export FliJ  38.52 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0940783  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3670  flagellar export FliJ  38.52 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3369  flagellar export FliJ  39.26 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0527  hypothetical protein  37.78 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6531  putative flagelar FliJ protein  36.3 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0822  flagellar export protein FliJ  34.91 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0782  flagellar export protein FliJ  34.91 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.107123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0745  flagellar export protein FliJ  34.91 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1543  hypothetical protein  34.23 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1600  hypothetical protein  34.23 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5575  flagellar export protein FliJ  32.71 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2214  hypothetical protein  35.71 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3948  flagellar export protein FliJ  32.81 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0169754  normal  0.155326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3620  flagellar export protein FliJ  32.03 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0307774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1568  hypothetical protein  35.14 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3489  flagellar export FliJ  31.15 
 
 
131 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0999561  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3078  hypothetical protein  29.73 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.409836 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2604  hypothetical protein  29.91 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3335  hypothetical protein  29.73 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1022  FliJ protein  34.86 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00652021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>