47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_12560 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_12560  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  192  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1319  hypothetical protein  40.78 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129436  normal  0.2348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1853  hypothetical protein  42.42 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1860  hypothetical protein  42.42 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.39326  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1712  integration host factor-like protein  45.63 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3196  putative integration host factor MihF  44.66 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0809  hypothetical protein  43 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0768002  normal  0.858288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3098  hypothetical protein  40.23 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2812  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1864  integration host factor  41.58 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3448  hypothetical protein  42.72 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2435  hypothetical protein  36.73 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33240  hypothetical protein  45.1 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1661  hypothetical protein  37.86 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371749  hitchhiker  0.0000841753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1696  hypothetical protein  41.49 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.877224  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1359  hypothetical protein  40.78 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  0.0604733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14790  hypothetical protein  44.34 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3207  hypothetical protein  34.69 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2260  putative integration host factor IHF  43.69 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.46856  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07810  hypothetical protein  37.86 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.175394  normal  0.797766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3156  hypothetical protein  45 
 
 
107 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  hitchhiker  0.0000150374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15610  hypothetical protein  46.97 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.167288  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5239  hypothetical protein  45.45 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1849  hypothetical protein  41.75 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317329  normal  0.137078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1714  hypothetical protein  40.51 
 
 
80 aa  57.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0927785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3008  hypothetical protein  41.84 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0876  hypothetical protein  39 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11900  hypothetical protein  38.38 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000932793  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1061  hypothetical protein  37.86 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4163  hypothetical protein  44.93 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1563  normal  0.37873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2041  hypothetical protein  41.75 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00591086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2579  putative integration host factor  39.71 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130539  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3741  MihF  43.08 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2369  MIHF  43.08 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2410  MihF  43.08 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18020  hypothetical protein  39.81 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00327498  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2416  MihF  43.08 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.623884  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2666  MihF  43.08 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11417  integration host factor mihF  42.03 
 
 
190 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282847  normal  0.291955 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12710  hypothetical protein  42.65 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0463914  normal  0.0241518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2344  hypothetical protein  43.08 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1294  putative integration host factor MihF  50.77 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203046  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5346  hypothetical protein  39.36 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1997  putative integration host factor IHF  51.96 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3128  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168775  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2993  hypothetical protein  36.36 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.65036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4411  hypothetical protein  35.14 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0253049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>