133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00130 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_00130  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1153    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06790  hypothetical protein  94.28 
 
 		 594 aa  1034    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0800  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  61.23 
 
 		 587 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2343  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  54.56 
 
 		 592 aa  554  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1575  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  54.79 
 
 		 592 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.016741  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06490  type IV secretory pathway, VirD4 component  40.38 
 
 		 634 aa  364  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00928914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0452  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  37.22 
 
 		 621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8942  conjugative transfer gene complex protein  38.2 
 
 		 613 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312755  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5436  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  36.89 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.561912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4706  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  31.94 
 
 		 490 aa  208  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220064  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2246  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  31.54 
 
 		 506 aa  183  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0689  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  31.62 
 
 		 636 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.01424  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5521  TRAG family protein  31.22 
 
 		 604 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1576  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  31.21 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540203  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4273  conjugative transfer gene complex protein  32.15 
 
 		 591 aa  156  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2361  hypothetical protein  32.78 
 
 		 598 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210389  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0263  conjugal transfer protein  28.36 
 
 		 583 aa  150  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0192996  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4500  conjugative transfer gene complex protein  28.5 
 
 		 589 aa  145  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.610328  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4560  putative TraG-family protein  29.17 
 
 		 589 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0985941 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4219  conjugative transfer gene complex protein  31.23 
 
 		 590 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0363  type IV secretory pathway VirD4 component  27.01 
 
 		 602 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.397437  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0604  hypothetical protein  30.33 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1438  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.43 
 
 		 562 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00273235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1381  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  27.38 
 
 		 656 aa  98.2  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3305  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  24.8 
 
 		 690 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000882445  normal  0.114382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  23.02 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  24.31 
 
 		 583 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  24.34 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  22.93 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  23.11 
 
 		 594 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  23.09 
 
 		 593 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  23.36 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  23.87 
 
 		 670 aa  77  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  23.56 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  23.32 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  25.49 
 
 		 660 aa  70.9  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  23.36 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  23.33 
 
 		 570 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4938  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  34.06 
 
 		 669 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  24.54 
 
 		 648 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  25 
 
 		 660 aa  70.1  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  22.5 
 
 		 559 aa  69.7  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  21.32 
 
 		 633 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  20.93 
 
 		 758 aa  67.4  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  23.28 
 
 		 548 aa  67  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  23.96 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  22.85 
 
 		 663 aa  63.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  23.52 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  22.72 
 
 		 662 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  24.29 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  22.27 
 
 		 756 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  23.88 
 
 		 560 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  23.4 
 
 		 661 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  21.98 
 
 		 633 aa  61.2  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  22.8 
 
 		 606 aa  60.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  22.85 
 
 		 664 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  23.15 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  23.6 
 
 		 668 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  23.17 
 
 		 669 aa  59.7  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  22.91 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  24.29 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  25.22 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  23.06 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  23.06 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  24.37 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  24.15 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  25.18 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  22.55 
 
 		 661 aa  57.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  23.02 
 
 		 661 aa  57.4  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  21.76 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  22.91 
 
 		 662 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  22.9 
 
 		 667 aa  56.2  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  23.09 
 
 		 670 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5331  TRAG family protein  27.78 
 
 		 658 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.390385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  22.2 
 
 		 662 aa  54.7  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  23.26 
 
 		 661 aa  54.7  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  23.82 
 
 		 561 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  22.78 
 
 		 666 aa  54.3  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  23.3 
 
 		 676 aa  53.9  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6215  TRAG family protein  21.23 
 
 		 902 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.371474 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  23.19 
 
 		 912 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  23.77 
 
 		 660 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  21.88 
 
 		 664 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  21.58 
 
 		 896 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  20.9 
 
 		 723 aa  52.4  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0918  TRAG family protein  21.45 
 
 		 677 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  22.22 
 
 		 668 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  21.58 
 
 		 661 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0206  putative type IV secretory pathway VirD4 protein  25.75 
 
 		 386 aa  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.415512  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  22.12 
 
 		 661 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  22.88 
 
 		 700 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  22.37 
 
 		 666 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  22.7 
 
 		 610 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3153  TRAG family protein  28.33 
 
 		 762 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  21 
 
 		 641 aa  50.8  0.00006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  21.88 
 
 		 661 aa  50.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  22.06 
 
 		 592 aa  50.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  20.2 
 
 		 714 aa  50.4  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  20.59 
 
 		 663 aa  50.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  23.38 
 
 		 687 aa  50.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>