31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2725 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2725  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  828    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2453  hypothetical protein  44.95 
 
 
401 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1367  hypothetical protein  41.21 
 
 
536 aa  262  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0689  hypothetical protein  35.59 
 
 
459 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0866657  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1045  hypothetical protein  32.08 
 
 
416 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2601  hypothetical protein  33.49 
 
 
443 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000556017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1982  hypothetical protein  34.44 
 
 
394 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000915947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2873  hypothetical protein  34.92 
 
 
399 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0118  hypothetical protein  33.58 
 
 
496 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2343  hypothetical protein  34.04 
 
 
513 aa  159  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.902991 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1395  hypothetical protein  30.68 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3661  hypothetical protein  32.69 
 
 
503 aa  152  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.159613  normal  0.176734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2244  hypothetical protein  30.35 
 
 
387 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.0297405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3046  hypothetical protein  30.71 
 
 
399 aa  150  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3256  hypothetical protein  30.6 
 
 
495 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2512  hypothetical protein  31.08 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2662  hypothetical protein  29.68 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723474  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2170  hypothetical protein  29.68 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3141  hypothetical protein  29.44 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1868  hypothetical protein  30.05 
 
 
385 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3009  hypothetical protein  30.07 
 
 
418 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0425000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1652  hypothetical protein  33.16 
 
 
505 aa  126  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1931  hypothetical protein  28.12 
 
 
393 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.930432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2937  hypothetical protein  26.35 
 
 
399 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.336844  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1938  hypothetical protein  27.07 
 
 
394 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.915381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1287  hypothetical protein  24.52 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.46065e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39000  hypothetical protein  28.2 
 
 
399 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00275655  normal  0.388299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0893  hypothetical protein  28.69 
 
 
442 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3321  hypothetical protein  27.96 
 
 
399 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2424  hypothetical protein  23.89 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3575  hypothetical protein  23.19 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>