135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2696 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2696  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  183  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.62763 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2959  hypothetical protein  71.26 
 
 
93 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2572  hypothetical protein  71.26 
 
 
93 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1142  hypothetical protein  69.32 
 
 
90 aa  140  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  72.94 
 
 
90 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  71.26 
 
 
90 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  71.76 
 
 
91 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  66.67 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  66.67 
 
 
90 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  66.67 
 
 
91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  59.77 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  59.77 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  65.52 
 
 
91 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  65.52 
 
 
91 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  65.52 
 
 
91 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  62.07 
 
 
90 aa  124  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  65.52 
 
 
91 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2175  hypothetical protein  65.52 
 
 
91 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  62.07 
 
 
90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2067  hypothetical protein  64.37 
 
 
91 aa  123  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1132  hypothetical protein  61.36 
 
 
90 aa  123  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1002  hypothetical protein  61.36 
 
 
90 aa  122  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0880728  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  63.22 
 
 
90 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  62.07 
 
 
90 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2194  hypothetical protein  63.22 
 
 
91 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.609831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2071  hypothetical protein  60.92 
 
 
114 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1752  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2778  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2261  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3058  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2644  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2700  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0938348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1533  hypothetical protein  60.92 
 
 
91 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.795875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  62.07 
 
 
91 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  60.92 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  60.92 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  59.77 
 
 
93 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0381  hypothetical protein  58.62 
 
 
90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1891  hypothetical protein  58.14 
 
 
89 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1902  hypothetical protein  58.14 
 
 
89 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2067  hypothetical protein  59.77 
 
 
90 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  57.47 
 
 
91 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1077  hypothetical protein  59.77 
 
 
91 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  60.92 
 
 
90 aa  115  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1169  hypothetical protein  59.77 
 
 
91 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0980986  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1235  hypothetical protein  59.77 
 
 
91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  64.37 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0856  hypothetical protein  60.92 
 
 
90 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  62.5 
 
 
91 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  62.2 
 
 
93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0121  hypothetical protein  61.84 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  60.92 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  0.0000118597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3964  hypothetical protein  56.32 
 
 
90 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1263  hypothetical protein  56.82 
 
 
90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.339369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0908  hypothetical protein  56.98 
 
 
95 aa  110  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431969  hitchhiker  0.00353106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  55.17 
 
 
90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3771  hypothetical protein  55.81 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0687  hypothetical protein  57.47 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.166712  normal  0.641044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1443  hypothetical protein  51.72 
 
 
92 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2437  hypothetical protein  51.72 
 
 
92 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1426  hypothetical protein  51.72 
 
 
92 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1521  hypothetical protein  50.57 
 
 
113 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5276  Fe(II) trafficking protein YggX  50 
 
 
91 aa  100  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2250  hypothetical protein  52.87 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000276973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  52.87 
 
 
90 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1544  hypothetical protein  52.27 
 
 
89 aa  95.9  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251513  normal  0.581544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0533  hypothetical protein  54.55 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000920147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1162  Fe(II) trafficking protein YggX  50.57 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  56 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  50.57 
 
 
91 aa  93.6  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  50.57 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  50.57 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000338126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03592  hypothetical protein  51.72 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1107  hypothetical protein  51.14 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149514  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2491  hypothetical protein  51.72 
 
 
91 aa  92  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427029  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01429  hypothetical protein  53.16 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3369  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  91.3  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1218  hypothetical protein  51.14 
 
 
92 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000284712  normal  0.540197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1179  hypothetical protein  48.86 
 
 
92 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882261  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1250  hypothetical protein  48.86 
 
 
92 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00387926  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68000  hypothetical protein  48.28 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291982  normal  0.0102639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1180  hypothetical protein  48.86 
 
 
92 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000191738  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5885  hypothetical protein  48.28 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3040  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000474974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2701  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1324  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000513126  normal  0.0116062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3054  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3197  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000564871  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04520  hypothetical protein  54.55 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.683421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3027  Fe(II) trafficking protein YggX  50.57 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02792  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0733  Protein-tyrosine-phosphatase  50 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0285  hypothetical protein  47.13 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02755  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2699  hypothetical protein  56 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000360658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4266  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3308  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0310  hypothetical protein  47.13 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12691  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0752  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.493276  normal  0.0113195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3105  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>