25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0508 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0508  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  337  8e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0582  hypothetical protein  36.42 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00912525  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  32.14 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  31.33 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  33.62 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  29.15 
 
 
203 aa  48.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1734  hypothetical protein  29.41 
 
 
424 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  27.78 
 
 
228 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  24.26 
 
 
190 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  28.24 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  29.3 
 
 
212 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  27.88 
 
 
207 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  32 
 
 
210 aa  44.7  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1127  hypothetical protein  26.86 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  28.85 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  34.58 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  32.18 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  30 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.06 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  41.6  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  29.89 
 
 
203 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  29.09 
 
 
198 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  37.04 
 
 
179 aa  41.2  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>