More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0491 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  517  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  517  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.22 
 
 
258 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.36 
 
 
258 aa  384  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.58 
 
 
258 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.67 
 
 
259 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  52.96 
 
 
253 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
258 aa  222  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.48 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
254 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.74 
 
 
249 aa  208  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.59 
 
 
296 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25790  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.53 
 
 
282 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
269 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
269 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
259 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.5 
 
 
249 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
269 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
263 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 
269 aa  184  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
276 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118299  decreased coverage  0.00158374 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
251 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.608737 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  42.37 
 
 
267 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
258 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.11 
 
 
258 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
267 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27130  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.49 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.11 
 
 
259 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
260 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  41.63 
 
 
266 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.59 
 
 
264 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.7 
 
 
258 aa  158  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
265 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
264 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
262 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
256 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
260 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
261 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
277 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  39.34 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
262 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
264 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
273 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2478  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.59 
 
 
262 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
257 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
264 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
260 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 
270 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.26 
 
 
263 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
262 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
264 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  39.82 
 
 
265 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 
270 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
263 aa  148  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  36.55 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
263 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
262 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
262 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.18 
 
 
270 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19470  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.27 
 
 
287 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
257 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
266 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
281 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
262 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.511264  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
281 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1864  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.33 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
266 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.05 
 
 
265 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  31.45 
 
 
265 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
269 aa  138  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
267 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
267 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  35.54 
 
 
268 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
266 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
265 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
272 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>