More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0188 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.212596  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.6 
 
 
247 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.35 
 
 
255 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0691518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.59 
 
 
240 aa  278  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.74 
 
 
244 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.74 
 
 
244 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.3 
 
 
246 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.23 
 
 
244 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.83 
 
 
245 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.14 
 
 
245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.45 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.12 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
237 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.27 
 
 
244 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.66 
 
 
244 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.47 
 
 
247 aa  240  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.42 
 
 
244 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.79 
 
 
245 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
240 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.23 
 
 
246 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 
246 aa  231  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
253 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  51.9 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
248 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.12 
 
 
245 aa  217  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 
247 aa  208  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  44.62 
 
 
252 aa  207  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.28 
 
 
252 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
247 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
252 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
246 aa  202  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.96 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
264 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.17 
 
 
317 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
246 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.49 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  40.56 
 
 
255 aa  189  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  42.74 
 
 
247 aa  186  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
248 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.82 
 
 
184 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000317715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
247 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
231 aa  168  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
231 aa  168  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  37.7 
 
 
239 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
249 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
250 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
259 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  37.92 
 
 
1367 aa  155  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
241 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  36.48 
 
 
239 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.54 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.1 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  39.33 
 
 
1270 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
243 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.97 
 
 
239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.02 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  34.31 
 
 
243 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
243 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
255 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
261 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
239 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
247 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
257 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
254 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
254 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
246 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
242 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0250  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.63 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.183431  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
252 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  34 
 
 
257 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  33.73 
 
 
257 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
243 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.138701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
239 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
241 aa  131  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.41 
 
 
258 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0256  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.45 
 
 
239 aa  129  6e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
233 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2290  3-hydroxy acid dehydrogenase  34.43 
 
 
249 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
230 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
240 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
259 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>