11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0053 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0053  tRNA-Tyr  100 
 
 
106 bp  210  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0054  tRNA-Tyr  89.62 
 
 
105 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0031  tRNA-OTHER  87.74 
 
 
106 bp  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.368519 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0033  tRNA-OTHER  85.05 
 
 
107 bp  77.8  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0051  tRNA-OTHER  93.18 
 
 
111 bp  63.9  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000231354  decreased coverage  0.00000000261131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0030  tRNA-Tyr  94.74 
 
 
116 bp  54  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0031  tRNA-Tyr  94.74 
 
 
109 bp  54  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00928668  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0028  tRNA-Phe  100 
 
 
74 bp  54  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0011  tRNA-Phe  100 
 
 
74 bp  54  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0010  tRNA-Phe  100 
 
 
74 bp  54  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0037  tRNA-Phe  100 
 
 
74 bp  54  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>