50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3132 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3132  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 134 aa  277  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.112593  hitchhiker  0.000898611 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0739  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.725007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 		 927 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.33 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 543 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 		 836 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1359  hypothetical protein  41.94 
 
 		 278 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000216686  decreased coverage  0.00000000415932 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  37.84 
 
 		 560 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 602 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  51.06 
 
 		 4079 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  43.64 
 
 		 296 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  47.06 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 465 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  41.27 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 452 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 574 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  38.33 
 
 		 623 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  45.1 
 
 		 240 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 		 366 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 1276 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23.42 
 
 		 1007 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  45.1 
 
 		 357 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 		 512 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1138 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 404 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  45.1 
 
 		 360 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  40.28 
 
 		 458 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  36.92 
 
 		 1979 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0124  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.62 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.62 
 
 		 2240 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 		 213 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 243 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  35.8 
 
 		 648 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 344 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  37.93 
 
 		 745 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.03 
 
 		 397 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  40.38 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2001  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.849251  normal  0.236756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.21 
 
 		 1694 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 878 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 596 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  38.18 
 
 		 573 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  46.94 
 
 		 523 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>