30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0252 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0252  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  355  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00157113  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0311  hypothetical protein  50.29 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0328154  normal  0.464529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  49.4 
 
 
229 aa  77.4  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  37.5 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2373  hypothetical protein  38.05 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0949277  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0251  hypothetical protein  41.03 
 
 
201 aa  60.8  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00204328  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2375  hypothetical protein  43.02 
 
 
233 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0026891  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  59.18 
 
 
236 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0310  hypothetical protein  27.88 
 
 
210 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685599  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  32.93 
 
 
229 aa  57.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0267  hypothetical protein  41.79 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.93762  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  36 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1541  hypothetical protein  33.7 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000440251  hitchhiker  0.0000169675 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  38.82 
 
 
271 aa  51.2  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0980  hypothetical protein  43.21 
 
 
210 aa  50.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186239  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0268  hypothetical protein  41.11 
 
 
212 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.590609  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0299  hypothetical protein  43.59 
 
 
232 aa  48.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1542  hypothetical protein  36.71 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000446761  hitchhiker  0.0000522987 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  39.74 
 
 
131 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  35.06 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3311  Protein of unknown function DUF1628  26.44 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1534  hypothetical protein  44.16 
 
 
211 aa  45.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000101739  normal  0.014347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  36.62 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1429  Protein of unknown function DUF1628  32.26 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.747471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2382  hypothetical protein  38.75 
 
 
241 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00520194  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  35.06 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  35.06 
 
 
136 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  39.76 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  34.18 
 
 
128 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3589  Protein of unknown function DUF1628  40.7 
 
 
215 aa  40.8  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>