17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1379 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1379  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
201 aa  400  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0301547  normal  0.108575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5427  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  90.5 
 
 
235 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4810  putative protease  79.29 
 
 
236 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513205  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4896  putative protease  79.29 
 
 
236 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5197  putative protease  79.29 
 
 
236 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213324  hitchhiker  0.000208925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13699  protease  73 
 
 
232 aa  303  9.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0599341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3226  hypothetical protein  42.41 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.86 
 
 
372 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  32.12 
 
 
496 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  30.13 
 
 
368 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  31.45 
 
 
501 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4913  hypothetical protein  29.17 
 
 
238 aa  44.7  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  30.43 
 
 
399 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  25.61 
 
 
522 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  25 
 
 
488 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.52 
 
 
378 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3387  hypothetical protein  26.99 
 
 
240 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>