31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2453 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2453  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  794    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2725  hypothetical protein  44.95 
 
 
414 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1045  hypothetical protein  35.29 
 
 
416 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1982  hypothetical protein  37.34 
 
 
394 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000915947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2873  hypothetical protein  35.62 
 
 
399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0689  hypothetical protein  33.59 
 
 
459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0866657  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1367  hypothetical protein  36.92 
 
 
536 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3661  hypothetical protein  33.16 
 
 
503 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.159613  normal  0.176734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3256  hypothetical protein  33.51 
 
 
495 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0118  hypothetical protein  31.33 
 
 
496 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2343  hypothetical protein  37.84 
 
 
513 aa  130  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.902991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2601  hypothetical protein  28.89 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000556017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3046  hypothetical protein  27.34 
 
 
399 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2244  hypothetical protein  27.47 
 
 
387 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.0297405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2937  hypothetical protein  28.84 
 
 
399 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.336844  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1868  hypothetical protein  28.35 
 
 
385 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2662  hypothetical protein  26.41 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723474  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2170  hypothetical protein  26.41 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1652  hypothetical protein  31.81 
 
 
505 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3141  hypothetical protein  26.09 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1931  hypothetical protein  26.74 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.930432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1938  hypothetical protein  26.43 
 
 
394 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.915381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3575  hypothetical protein  29.3 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1395  hypothetical protein  23.8 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2424  hypothetical protein  28.98 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2512  hypothetical protein  26.53 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3009  hypothetical protein  29.07 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0425000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1287  hypothetical protein  25.66 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.46065e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39000  hypothetical protein  25.42 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00275655  normal  0.388299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3321  hypothetical protein  25.67 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0893  hypothetical protein  28 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>