63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2430 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2430  DoxX  100 
 
 
134 aa  258  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00251481  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  32 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  35.88 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  35.77 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  35.77 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  35.77 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  35.77 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  34.71 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  31.71 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  34.71 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  34.71 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  34.96 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  35.83 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  32.52 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  32.59 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  35 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  34.71 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  35 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  35 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  35 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  35 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  33.06 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  33.06 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  30.3 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3519  DoxX family protein  38.02 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  34.17 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  36.73 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  34.17 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  36.73 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  36.73 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  30.3 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  30.77 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  34.68 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  34.11 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  33.33 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  32.56 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  33.02 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3393  DoxX family protein  34.96 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  29.1 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  27.97 
 
 
136 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  29.46 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  32.09 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  31.21 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  28.36 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  29.03 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  28.57 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  27.42 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  26.47 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  29.77 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  29.01 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  29.77 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  29.1 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5793  hypothetical protein  37.21 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  32.33 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  29.47 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  26.61 
 
 
137 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  28.42 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  29.51 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  28.42 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  29.51 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  29.27 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0520  DoxX family protein  33.33 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0738  DoxX family protein  33.88 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>