30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0963 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0963  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
53 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000876713  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  95.83 
 
 
260 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1757  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.44 
 
 
255 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1866  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.78 
 
 
261 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0975592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0615  tRNA/rRNA methyltransferase  59.57 
 
 
260 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1419  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  52.27 
 
 
259 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.253348  normal  0.0498541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.56 
 
 
262 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000674359  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1357  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.27 
 
 
260 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.27 
 
 
260 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2567  RNA methyltransferase  47.92 
 
 
281 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2042  RNA methyltransferase  47.83 
 
 
281 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1312  RNA methyltransferase  50 
 
 
262 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000359271  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2477  RNA methyltransferase  50 
 
 
262 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1540  RNA methyltransferase  50 
 
 
262 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00191583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2421  RNA methyltransferase  50 
 
 
262 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3271  RNA methyltransferase  50 
 
 
262 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2040  RNA methyltransferase  50 
 
 
262 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000808188  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1870  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.54 
 
 
279 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1697  putative RNA methylase  51.16 
 
 
275 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.89 
 
 
277 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.16 
 
 
266 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.411274  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2440  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.83 
 
 
275 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0504626  normal  0.0195288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5314  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.84 
 
 
260 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300522  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.84 
 
 
260 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6073  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.84 
 
 
260 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2024  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.84 
 
 
260 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146805  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.84 
 
 
260 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479292  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1906  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.84 
 
 
260 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.602195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2037  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.84 
 
 
260 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.859577  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2680  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.34 
 
 
260 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>