40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0575 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0575  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000185877  normal  0.010327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2975  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.85 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1495  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.12 
 
 
373 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  31.78 
 
 
415 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.08 
 
 
375 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  31.13 
 
 
411 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 
405 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  23.68 
 
 
373 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  41.18 
 
 
389 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  29.33 
 
 
457 aa  45.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  40.54 
 
 
511 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  30.85 
 
 
443 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2919  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.26 
 
 
558 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  hitchhiker  0.00800528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  32.99 
 
 
502 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1844  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.23 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.880462  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  30.59 
 
 
577 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4090  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.9 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  37.1 
 
 
388 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  44.12 
 
 
490 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
386 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.02 
 
 
556 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.7 
 
 
312 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  33.8 
 
 
407 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  43.08 
 
 
450 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  43.08 
 
 
450 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  43.08 
 
 
450 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  44.26 
 
 
450 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  37.14 
 
 
495 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  34.83 
 
 
494 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  37.88 
 
 
489 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  30.53 
 
 
424 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  27.27 
 
 
442 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  38.57 
 
 
462 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  40.58 
 
 
623 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  32.63 
 
 
369 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  34.83 
 
 
494 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  32.32 
 
 
453 aa  42  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.94 
 
 
442 aa  42  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  43.75 
 
 
426 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  29.58 
 
 
452 aa  42  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>