181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl630 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl630  putative translation factor  100 
 
 
168 aa  323  5e-88  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.948941  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0147  hypothetical protein  53.25 
 
 
166 aa  153  1e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.226313  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1260  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.63 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00492608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0890  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  22.99 
 
 
215 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18310  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.35 
 
 
440 aa  61.2  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.24 
 
 
209 aa  60.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00392606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3929  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  21.3 
 
 
258 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.896953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1012  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  22.5 
 
 
216 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837821  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1208  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.58 
 
 
192 aa  57.4  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.14 
 
 
335 aa  57.4  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  22.44 
 
 
236 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0460  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.95 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0414  hypothetical protein  30 
 
 
280 aa  55.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3718  translation factor SUA5  23.26 
 
 
216 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.06 
 
 
322 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.35 
 
 
335 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2417  translation factor SUA5  22.67 
 
 
259 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.909334  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.32 
 
 
366 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1753  translation factor SUA5  25.19 
 
 
219 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25 
 
 
216 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.95 
 
 
344 aa  53.9  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00940805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1063  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  21.76 
 
 
236 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0046  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  25 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1462  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.17 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1307  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  23.46 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.816543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3878  putative ribosome maturation factor  25.73 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000521724  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1975  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.36 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213074  normal  0.800217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0621  putative ribosome maturation factor  25.73 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000135377  normal  0.0218454 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  22.86 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1466  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0320  putative ribosome maturation factor  25.73 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00340055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03133  predicted ribosome maturation factor  24.44 
 
 
190 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00993988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0431  SUA5/yciO/yrdC domain protein  24.44 
 
 
190 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000149236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03084  hypothetical protein  24.44 
 
 
190 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.017933  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.13 
 
 
331 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3476  putative ribosome maturation factor  24.44 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000439267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3765  putative ribosome maturation factor  24.44 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000551499  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1428  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.08 
 
 
225 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03541  putative translation factor (SUA5)  26.87 
 
 
196 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3667  putative ribosome maturation factor  24.44 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0431  putative ribosome maturation factor  24.44 
 
 
190 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000651725  hitchhiker  0.00293146 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0511  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.14 
 
 
210 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19220  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.07 
 
 
347 aa  52  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3578  putative ribosome maturation factor  24.44 
 
 
190 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000356689  normal  0.210928 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1671  SUA5/yciO/yrdC domain protein  32.14 
 
 
185 aa  52  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1536  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30 
 
 
198 aa  51.6  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0443  SUA5/yciO/yrdC domain protein  25.86 
 
 
189 aa  51.2  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29640  translation factor SUA5  20.62 
 
 
216 aa  51.2  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4605  putative ribosome maturation factor  24.44 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00037483  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0040  translation factor SUA5  28.12 
 
 
188 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.123848  hitchhiker  0.00000448294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0643  translation factor SUA5  21.64 
 
 
219 aa  50.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.76 
 
 
203 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3785  SUA5/yciO/yrdC domain protein  23.66 
 
 
189 aa  50.8  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000349894  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.28 
 
 
189 aa  50.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.995605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0326  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  23.91 
 
 
261 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1911  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  17.92 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0227431  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  28.47 
 
 
342 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0134  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.92 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21600  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.14 
 
 
202 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1658  Sua5_yciO_yrdC, YrdC domain protein  22.73 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  26.28 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5958  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.78 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0703891  normal  0.0596228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  26.79 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3714  putative ribosome maturation factor  25.14 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0011772  normal  0.0258765 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.38 
 
 
352 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3964  SUA5/yciO/yrdC domain protein  23.66 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.81 
 
 
202 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0034  translation factor SUA5  27.33 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.12599  hitchhiker  0.00900731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0032  translation factor SUA5  27.33 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.86833  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  22.36 
 
 
318 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4507  putative ribosome maturation factor  22.16 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000123843  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1207  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.05 
 
 
216 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.08 
 
 
358 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1031  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.82 
 
 
202 aa  48.5  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  21.79 
 
 
246 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.46 
 
 
202 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.61 
 
 
204 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  27.94 
 
 
337 aa  48.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09940  translation factor SUA5  21.43 
 
 
251 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0281  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.08 
 
 
358 aa  48.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000413141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0027  putative RNA-binding protein  27.59 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.667549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.81 
 
 
202 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.29 
 
 
202 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0019  SUA5/yciO/yrdC-like  23.73 
 
 
186 aa  47.8  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2617  translation factor SUA5  22.88 
 
 
245 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0742122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  22.09 
 
 
205 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.4 
 
 
335 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.14 
 
 
317 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0820  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.78 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.130442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0360  SUA5/yciO/yrdC domain protein  23.26 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  22.56 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3738  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.68 
 
 
221 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0321  hypothetical protein  27.46 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2309  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  22.01 
 
 
221 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.569528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  24.68 
 
 
350 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2512  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.82 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36787  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1308  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.46 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0037  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.16 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0802  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.57 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.173581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1501  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  23.03 
 
 
212 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000418868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>