221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl275 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl275  protein-export membrane protein  100 
 
 		 1336 aa  2679    Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00136953  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0498  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1404 aa  562  1e-158  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  22.22 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  24.38 
 
 		 470 aa  63.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  24.53 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  22.86 
 
 		 531 aa  61.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  28.4 
 
 		 533 aa  61.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  26.81 
 
 		 599 aa  60.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.33 
 
 		 754 aa  60.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  28.4 
 
 		 615 aa  60.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.33 
 
 		 754 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  25.5 
 
 		 419 aa  60.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  25.5 
 
 		 419 aa  60.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.3 
 
 		 995 aa  60.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.95 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.95 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.95 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  23.03 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  24.52 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  23.03 
 
 		 613 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  23.03 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.95 
 
 		 754 aa  60.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.95 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.57 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.57 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1021  preprotein translocase subunit SecD  26.05 
 
 		 604 aa  58.9  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3289  preprotein translocase subunit SecD  28.36 
 
 		 604 aa  58.9  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  26.29 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  25.6 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1617  preprotein translocase subunit SecD  27.46 
 
 		 618 aa  58.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00434823  normal  0.598494 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  24.16 
 
 		 604 aa  58.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1764  SecD export membrane protein  28.57 
 
 		 488 aa  57.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00179292  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  26.06 
 
 		 529 aa  57.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  22.5 
 
 		 554 aa  58.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  23.46 
 
 		 554 aa  57.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  26.7 
 
 		 470 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  26.7 
 
 		 470 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  23.27 
 
 		 533 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  22.67 
 
 		 495 aa  57.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  24.48 
 
 		 594 aa  56.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  23.85 
 
 		 495 aa  56.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  26.52 
 
 		 521 aa  57  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  24.48 
 
 		 594 aa  56.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  23.97 
 
 		 534 aa  57  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.15 
 
 		 856 aa  56.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  27.85 
 
 		 620 aa  57  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  23.84 
 
 		 793 aa  56.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  24.82 
 
 		 614 aa  56.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  28.29 
 
 		 616 aa  55.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  26.7 
 
 		 1001 aa  55.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  24.1 
 
 		 638 aa  55.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  26.09 
 
 		 415 aa  55.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  26.85 
 
 		 615 aa  55.5  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1415  protein-export membrane protein SecD  23.9 
 
 		 622 aa  55.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1230  preprotein translocase subunit SecD  23.9 
 
 		 622 aa  55.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.888537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.24 
 
 		 853 aa  55.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.14 
 
 		 752 aa  55.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  23.12 
 
 		 464 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.84 
 
 		 763 aa  54.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  23.85 
 
 		 493 aa  54.3  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  23.04 
 
 		 461 aa  54.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  25.21 
 
 		 533 aa  54.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  29.14 
 
 		 618 aa  54.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.57 
 
 		 750 aa  55.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  28.48 
 
 		 607 aa  55.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  18.91 
 
 		 441 aa  53.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  23.23 
 
 		 532 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  25.37 
 
 		 595 aa  54.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  27.81 
 
 		 607 aa  53.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  22.28 
 
 		 487 aa  53.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00522  preprotein translocase subunit SecD  26.9 
 
 		 614 aa  53.5  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  26.85 
 
 		 623 aa  54.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  23.03 
 
 		 619 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  27.33 
 
 		 622 aa  54.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  26 
 
 		 615 aa  53.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.29 
 
 		 755 aa  53.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  26.54 
 
 		 604 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  26.54 
 
 		 604 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.43 
 
 		 750 aa  53.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  26.71 
 
 		 416 aa  53.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  24.37 
 
 		 533 aa  53.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  28.22 
 
 		 604 aa  53.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  26.54 
 
 		 615 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  28.22 
 
 		 615 aa  53.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  26.54 
 
 		 615 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.12 
 
 		 759 aa  52.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  23.12 
 
 		 556 aa  53.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  26.54 
 
 		 615 aa  52.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  26.54 
 
 		 615 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  28.22 
 
 		 615 aa  53.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.12 
 
 		 759 aa  52.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  26.54 
 
 		 615 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40460  preprotein translocase subunit SecD  27.54 
 
 		 622 aa  52.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  26.54 
 
 		 615 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  26.54 
 
 		 615 aa  52.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0272  preprotein translocase subunit SecD  28.48 
 
 		 617 aa  53.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424344  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0941  preprotein translocase subunit SecD  22.76 
 
 		 625 aa  52.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566023 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  21.53 
 
 		 489 aa  52.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  22.93 
 
 		 489 aa  52.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.32 
 
 		 996 aa  52.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>