More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl076 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl076  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  100 
 
 
347 aa  712    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.687526  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0104  phosphoribosylpyrophosphate synthase  73.67 
 
 
344 aa  501  1e-141  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  46.13 
 
 
326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0183  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.13 
 
 
331 aa  300  2e-80  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  45.23 
 
 
327 aa  295  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.82 
 
 
325 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.9 
 
 
319 aa  292  6e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.9 
 
 
319 aa  291  9e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.39 
 
 
315 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.5 
 
 
316 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.37 
 
 
315 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.82 
 
 
316 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.2 
 
 
317 aa  285  9e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.15 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 
317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.3 
 
 
314 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.31 
 
 
329 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.17 
 
 
316 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.95 
 
 
329 aa  280  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.4 
 
 
315 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.44 
 
 
317 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.37 
 
 
314 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  45.06 
 
 
312 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  44.27 
 
 
317 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.14 
 
 
314 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.32 
 
 
321 aa  276  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.26 
 
 
316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.44 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.32 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.32 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.17 
 
 
325 aa  273  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.51 
 
 
315 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.63 
 
 
322 aa  271  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.62 
 
 
314 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.95 
 
 
321 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  43.95 
 
 
321 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.72 
 
 
314 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.27 
 
 
318 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.5 
 
 
310 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.12 
 
 
314 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.54 
 
 
322 aa  265  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.49 
 
 
323 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.42 
 
 
325 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.27 
 
 
326 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.12 
 
 
317 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.21 
 
 
330 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.07 
 
 
326 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.46 
 
 
326 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.81 
 
 
313 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.24 
 
 
319 aa  262  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.23 
 
 
326 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.85 
 
 
322 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.74 
 
 
314 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.69 
 
 
310 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.18 
 
 
324 aa  261  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.16 
 
 
331 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.21 
 
 
317 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf112  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.98 
 
 
324 aa  260  2e-68  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.56 
 
 
311 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.69 
 
 
310 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.81 
 
 
325 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.19 
 
 
317 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.98 
 
 
338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.03 
 
 
317 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  42.15 
 
 
325 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.77 
 
 
325 aa  258  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.14 
 
 
316 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.17 
 
 
314 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.72 
 
 
331 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.1 
 
 
324 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  42.47 
 
 
321 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.45 
 
 
309 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.61 
 
 
319 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.17 
 
 
322 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  39.26 
 
 
316 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.94 
 
 
315 aa  257  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  39.94 
 
 
313 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  40.18 
 
 
319 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.22 
 
 
327 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.77 
 
 
311 aa  257  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.22 
 
 
327 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.8 
 
 
318 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.43 
 
 
317 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.69 
 
 
359 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.77 
 
 
309 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.8 
 
 
318 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.19 
 
 
331 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.25 
 
 
320 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.51 
 
 
310 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>