More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3526 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3526  LysR substrate-binding  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4339  transcriptional regulator, LysR family  69.74 
 
 		 322 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1715  transcriptional regulator, LysR family  52.6 
 
 		 321 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4808  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 312 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123688  hitchhiker  0.000340462 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6327  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16470  transcriptional regulator, LysR family  41.32 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0493  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3870  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.618692 
 
 
-
 
NC_003296  RS00906  transcription regulator protein  41.32 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.440828 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4725  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 290 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0474  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1392  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000534606  normal  0.185395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.39 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06651  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  35.29 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001136  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0434  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 305 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000421  transcriptional regulator  31.42 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.423035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2575  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  33.1 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1993  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0556  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0580  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0551  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1244  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 327 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0579  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.0538028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3299  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4614  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23540  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483794 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5229  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3680  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4056  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.14 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.27 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4131  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.22 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  31.51 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>