250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2965 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2965  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3191  deoxyribose-phosphate aldolase  95.33 
 
 		 257 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3147  deoxyribose-phosphate aldolase  83.2 
 
 		 252 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3924  deoxyribose-phosphate aldolase  64.83 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  0.560793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4176  deoxyribose-phosphate aldolase  57.89 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4464  deoxyribose-phosphate aldolase  56.58 
 
 		 258 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.45684  normal  0.484684 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1929  deoxyribose-phosphate aldolase  50.22 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278223  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03377  deoxyribose-phosphate aldolase  50.44 
 
 		 258 aa  218  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002629  deoxyribose-phosphate aldolase  50.44 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0982616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0619  deoxyribose-phosphate aldolase  50.44 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1041  deoxyribose-phosphate aldolase  48.76 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000759939  hitchhiker  0.0000000245827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3366  deoxyribose-phosphate aldolase  48.35 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0201919  hitchhiker  0.00182556 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3230  deoxyribose-phosphate aldolase  48.35 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000791533  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1025  deoxyribose-phosphate aldolase  47.13 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0327864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1140  deoxyribose-phosphate aldolase  48.35 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121446  hitchhiker  0.000000000107327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2822  deoxyribose-phosphate aldolase  48.35 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0142613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1217  deoxyribose-phosphate aldolase  48.76 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1037  deoxyribose-phosphate aldolase  48.35 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000255358  hitchhiker  0.00000000038702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3227  deoxyribose-phosphate aldolase  48.35 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.178533  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1102  deoxyribose-phosphate aldolase  48.35 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0215015  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0264  deoxyribose-phosphate aldolase  51.07 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0599  deoxyribose-phosphate aldolase  50.66 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3048  deoxyribose-phosphate aldolase  47.3 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000145781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3333  deoxyribose-phosphate aldolase  50.63 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2815  deoxyribose-phosphate aldolase  47.13 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00272907  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1972  deoxyribose-phosphate aldolase  45.8 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0806419  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0140  deoxyribose-phosphate aldolase  43.98 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2186  deoxyribose-phosphate aldolase  43.98 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.446123  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0831  deoxyribose-phosphate aldolase  48.48 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0831  deoxyribose-phosphate aldolase  54.08 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0660  deoxyribose-phosphate aldolase  48.47 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3498  deoxyribose-phosphate aldolase  48.48 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3549  deoxyribose-phosphate aldolase  46.89 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0216784  hitchhiker  0.0000418325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1002  deoxyribose-phosphate aldolase  46.89 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000944927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3627  deoxyribose-phosphate aldolase  48.05 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3378  deoxyribose-phosphate aldolase  46.89 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000747392  hitchhiker  0.00551238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0973  deoxyribose-phosphate aldolase  49.78 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.048409  hitchhiker  0.000997229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0541  deoxyribose-phosphate aldolase  48.1 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0440112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04257  deoxyribose-phosphate aldolase  48.02 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.707451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04223  hypothetical protein  48.02 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4616  deoxyribose-phosphate aldolase  48.02 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4980  deoxyribose-phosphate aldolase  48.02 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3675  deoxyribose-phosphate aldolase  48.02 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.635596  normal  0.0472404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5896  deoxyribose-phosphate aldolase  48.02 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4930  deoxyribose-phosphate aldolase  47.58 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4928  deoxyribose-phosphate aldolase  47.58 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3617  deoxyribose-phosphate aldolase  47.58 
 
 		 259 aa  198  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3452  deoxyribose-phosphate aldolase  49.57 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4923  deoxyribose-phosphate aldolase  46.7 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4889  deoxyribose-phosphate aldolase  46.7 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4821  deoxyribose-phosphate aldolase  46.7 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4982  deoxyribose-phosphate aldolase  46.7 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4975  deoxyribose-phosphate aldolase  46.7 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2862  deoxyribose-phosphate aldolase  45.81 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1068  deoxyribose-phosphate aldolase  49.36 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2811  deoxyribose-phosphate aldolase  49.36 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2666  deoxyribose-phosphate aldolase  49.36 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0110  deoxyribose-phosphate aldolase  49.36 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0410  deoxyribose-phosphate aldolase  48.94 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1271  deoxyribose-phosphate aldolase  49.36 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0130  deoxyribose-phosphate aldolase  49.36 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0640  deoxyribose-phosphate aldolase  51.49 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3249  deoxyribose-phosphate aldolase  44.35 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0363  deoxyribose-phosphate aldolase  44.9 
 
 		 313 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0743  deoxyribose-phosphate aldolase  42.26 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0777  Deoxyribose-phosphate aldolase  42.08 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0973  deoxyribose-phosphate aldolase  42.79 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000205356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0839  deoxyribose-phosphate aldolase  41.18 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000295758  decreased coverage  0.000077294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0850  deoxyribose-phosphate aldolase  43.93 
 
 		 307 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3739  deoxyribose phosphate aldolase  41.11 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3271  deoxyribose-phosphate aldolase  39.68 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3016  deoxyribose-phosphate aldolase  40.4 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0930267  normal  0.304024 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3471  deoxyribose-phosphate aldolase  40.71 
 
 		 324 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  39.76 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.259546 
 
 
-
 
NC_002950  PG1996  deoxyribose-phosphate aldolase  38.96 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.734647 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3897  deoxyribose-phosphate aldolase  41.46 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0208  deoxyribose-phosphate aldolase  40.64 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0828  deoxyribose-phosphate aldolase  40.23 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0758191 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3349  ribokinase  41.11 
 
 		 324 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0799  deoxyribose-phosphate aldolase  42.17 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0097  deoxyribose-phosphate aldolase  38.8 
 
 		 351 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2837  deoxyribose-phosphate aldolase  37.7 
 
 		 319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7828  putative deoxyribose-phosphate aldolase (DERA)  39.92 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1349  deoxyribose-phosphate aldolase  39.52 
 
 		 327 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4631  deoxyribose-phosphate aldolase  39.76 
 
 		 334 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698385  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05510  deoxyribose-phosphate aldolase  40.25 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1275  deoxyribose-phosphate aldolase  39.68 
 
 		 336 aa  144  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.085183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0314  deoxyribose-phosphate aldolase  37.55 
 
 		 333 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0789  deoxyribose-phosphate aldolase  37.6 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2688  deoxyribose-phosphate aldolase  38.58 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2280  deoxyribose-phosphate aldolase  38.74 
 
 		 322 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1399  deoxyribose-phosphate aldolase  39.13 
 
 		 336 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61762  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4390  deoxyribose-phosphate aldolase  39.37 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.619878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2232  deoxyribose-phosphate aldolase  38.49 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0991919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5196  deoxyribose-phosphate aldolase  39.13 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4652  deoxyribose-phosphate aldolase  37.3 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3528  deoxyribose-phosphate aldolase  39.34 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1608  hypothetical protein  35.06 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1388  hypothetical protein  35.5 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  34.95 
 
 		 222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>