More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2398 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2357  preprotein translocase subunit SecA  89.78 
 
 		 685 aa  1172    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.543431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2398  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 678 aa  1355    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1343  preprotein translocase subunit SecA  52.02 
 
 		 663 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0620  preprotein translocase subunit SecA  50.08 
 
 		 668 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0924  preprotein translocase subunit SecA  46.04 
 
 		 666 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2175  preprotein translocase subunit SecA  45.71 
 
 		 658 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.407443  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  42.02 
 
 		 864 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  45.47 
 
 		 838 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  43.31 
 
 		 787 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  41.86 
 
 		 858 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  42.01 
 
 		 886 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  45.22 
 
 		 833 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  43.11 
 
 		 837 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  40.03 
 
 		 824 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  44.7 
 
 		 844 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  42.14 
 
 		 848 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  44 
 
 		 859 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  44.34 
 
 		 834 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  39.88 
 
 		 862 aa  431  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0365  protein translocase subunit secA  41.55 
 
 		 787 aa  431  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  41.16 
 
 		 901 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  41.16 
 
 		 901 aa  428  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  41.16 
 
 		 901 aa  428  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  41.16 
 
 		 901 aa  429  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  41.16 
 
 		 901 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  41.01 
 
 		 901 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  39.6 
 
 		 884 aa  428  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  41.16 
 
 		 901 aa  428  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  41.16 
 
 		 901 aa  428  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  39.85 
 
 		 862 aa  426  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1214  preprotein translocase subunit SecA  40.09 
 
 		 871 aa  429  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  44.25 
 
 		 796 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  43.88 
 
 		 840 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  41.16 
 
 		 901 aa  428  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1241  preprotein translocase subunit SecA  40.09 
 
 		 871 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00118655  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  40.15 
 
 		 901 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  41.3 
 
 		 866 aa  425  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  40.53 
 
 		 863 aa  424  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  39.1 
 
 		 925 aa  425  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  40.4 
 
 		 901 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  40.4 
 
 		 901 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  40.4 
 
 		 901 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  40.4 
 
 		 901 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  44.5 
 
 		 837 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  40.91 
 
 		 911 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  42.36 
 
 		 840 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  42.36 
 
 		 845 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  40.68 
 
 		 844 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  39.34 
 
 		 862 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  41.65 
 
 		 845 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0248  preprotein translocase subunit SecA  40.55 
 
 		 929 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  43.5 
 
 		 836 aa  422  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  39.35 
 
 		 857 aa  422  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0274  preprotein translocase subunit SecA  40.72 
 
 		 926 aa  422  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  40.85 
 
 		 868 aa  422  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3262  preprotein translocase subunit SecA  40.62 
 
 		 797 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  43.08 
 
 		 799 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  40.67 
 
 		 934 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  39.51 
 
 		 862 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  41.67 
 
 		 933 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  44.05 
 
 		 842 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  40.67 
 
 		 868 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  40.87 
 
 		 914 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  40.36 
 
 		 909 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  40.33 
 
 		 931 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  40.4 
 
 		 910 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  40.33 
 
 		 931 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  40.33 
 
 		 931 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  43.91 
 
 		 836 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  38.81 
 
 		 910 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  40.33 
 
 		 931 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  40.33 
 
 		 931 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  41.83 
 
 		 930 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0232  preprotein translocase, SecA subunit  39.38 
 
 		 804 aa  416  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  40.33 
 
 		 931 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  40.59 
 
 		 912 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  39.85 
 
 		 930 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  41.64 
 
 		 912 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  40.71 
 
 		 914 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  41.37 
 
 		 830 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  40.33 
 
 		 931 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  39.11 
 
 		 862 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  40.79 
 
 		 912 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  40.39 
 
 		 914 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  40.74 
 
 		 934 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0589  preprotein translocase subunit SecA  38.81 
 
 		 853 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  39.76 
 
 		 917 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  40.03 
 
 		 932 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  40.19 
 
 		 843 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  40.52 
 
 		 934 aa  416  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  39.61 
 
 		 897 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30890  preprotein translocase subunit SecA  40.35 
 
 		 955 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  41.99 
 
 		 932 aa  416  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  39.88 
 
 		 931 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  39.88 
 
 		 931 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  41.99 
 
 		 932 aa  416  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2687  preprotein translocase subunit SecA  39.82 
 
 		 912 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  40.78 
 
 		 1009 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  39.52 
 
 		 855 aa  415  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0287  preprotein translocase subunit SecA  38.8 
 
 		 964 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.196625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>