70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0166 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0166  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0084  hypothetical protein  98.9 
 
 		 91 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2948  hypothetical protein  86.02 
 
 		 93 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0077  hypothetical protein  97.47 
 
 		 93 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1346  hypothetical protein  87.91 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  hitchhiker  0.000296751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3985  hypothetical protein  87.91 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5542  hypothetical protein  76.4 
 
 		 90 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1049  hypothetical protein  76.47 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7962  hypothetical protein  74.42 
 
 		 90 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.027631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2497  hypothetical protein  72.5 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.514422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4248  hypothetical protein  71.05 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287019  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  86.89 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2963  hypothetical protein  69.66 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2034  hypothetical protein  53.66 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3694  hypothetical protein  50.62 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3695  hypothetical protein  49.35 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1620  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1480  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1798  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.320432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0164  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1161  hypothetical protein  46.75 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178544  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0557  hypothetical protein  44.74 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1419  hypothetical protein  45 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3737  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00728994  normal  0.292015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2535  hypothetical protein  40.96 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1740  hypothetical protein  41.56 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3184  hypothetical protein  60.27 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0876  hypothetical protein  45.21 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271927  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1734  hypothetical protein  43.59 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1502  hypothetical protein  43.04 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1313  hypothetical protein  50.79 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.214688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2635  hypothetical protein  42.11 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1042  hypothetical protein  49.18 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.980568  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0180  hypothetical protein  51.9 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0123  hypothetical protein  47.5 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2680  hypothetical protein  50.65 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3293  hypothetical protein  51.95 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.587635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2078  hypothetical protein  45.83 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3610  hypothetical protein  45.83 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1659  hypothetical protein  45.83 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178857  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3346  hypothetical protein  45.83 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319255  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2750  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.897901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2977  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2872  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3594  hypothetical protein  51.95 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0462  hypothetical protein  38.36 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.781265  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0576  hypothetical protein  35.9 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.191205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4670  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0989  hypothetical protein  51.11 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.684189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6866  hypothetical protein  49.37 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  0.022304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1426  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1405  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1221  hypothetical protein  51.11 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.661908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3979  hypothetical protein  51.11 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121303  normal  0.274015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3227  hypothetical protein  45.68 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5200  hypothetical protein  47.44 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5968  hypothetical protein  47.44 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2455  conserved hypothetical protein-like protein  46.75 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2066  hypothetical protein  50.68 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576605  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0915  hypothetical protein  48.72 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1557  hypothetical protein  38.24 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1696  hypothetical protein  48.08 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000802562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2443  hypothetical protein  45.61 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3699  hypothetical protein  45.65 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3367  hypothetical protein  48.89 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1916  hypothetical protein  38.16 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.863299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0130  hypothetical protein  42.5 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0430  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2697  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1691  hypothetical protein  46.81 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>