More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2389 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2389  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000000216115  n/a   
 
 
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  37.91 
 
 
325 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.2 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.93 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  35.95 
 
 
330 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.38 
 
 
337 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.54 
 
 
336 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.05 
 
 
324 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  38.03 
 
 
332 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.62 
 
 
318 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  36.82 
 
 
317 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.51 
 
 
339 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  36.49 
 
 
317 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.5 
 
 
332 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  36.36 
 
 
395 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  36.81 
 
 
327 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39 
 
 
339 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  36.94 
 
 
336 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  35.31 
 
 
344 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  35.47 
 
 
351 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.8 
 
 
353 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 
328 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.15 
 
 
325 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.19 
 
 
326 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.78 
 
 
327 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  36.09 
 
 
330 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.34 
 
 
320 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  36.45 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.51 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  35.06 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  36.98 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  35.91 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.44 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  37.58 
 
 
328 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.57 
 
 
345 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  37.71 
 
 
333 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  36.33 
 
 
312 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.57 
 
 
345 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.22 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.04 
 
 
344 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  36.42 
 
 
335 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  36.62 
 
 
338 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  34.56 
 
 
327 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.87 
 
 
334 aa  199  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  38.16 
 
 
329 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.78 
 
 
323 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  38.26 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  36.96 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  33.12 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.22 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40.13 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.67 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  36.86 
 
 
333 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  35.48 
 
 
339 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  37.3 
 
 
326 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  36.48 
 
 
332 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.91 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  35.59 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  33.54 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  36.22 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  36.79 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  35.22 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  34.81 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  35.69 
 
 
322 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  35.35 
 
 
323 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  34.67 
 
 
324 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.28 
 
 
334 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  36.84 
 
 
331 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  34.78 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  36.56 
 
 
326 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  34.59 
 
 
344 aa  195  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  35.2 
 
 
332 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  35.02 
 
 
356 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.54 
 
 
328 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  34.95 
 
 
331 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  36.24 
 
 
323 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.38 
 
 
331 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  37.81 
 
 
356 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  36.61 
 
 
321 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  34.77 
 
 
325 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  39.74 
 
 
325 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  37.58 
 
 
333 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.73 
 
 
328 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.42 
 
 
328 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  36.89 
 
 
310 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  37.16 
 
 
319 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  34.44 
 
 
335 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1351  Fis family transcriptional regulator  36.27 
 
 
312 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  33.44 
 
 
327 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.93 
 
 
336 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  37.54 
 
 
342 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  36.09 
 
 
329 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  36.91 
 
 
323 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  34.98 
 
 
324 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  34.48 
 
 
326 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  36.39 
 
 
330 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.02 
 
 
330 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  35.22 
 
 
337 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  32.91 
 
 
323 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  32.52 
 
 
347 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>