More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0053 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0012  16S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 1477 bp  1677    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.579936  normal  0.0913592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0053  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1481 bp  2936    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.497813  normal  0.0940245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0001  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1481 bp  2936    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000152569  normal  0.236967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0005  16S ribosomal RNA  89.55 
 
 		 1477 bp  1677    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000146782  normal  0.725323 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_R0067  16S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 1493 bp  815    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0037685  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0002  16S ribosomal RNA  82.8 
 
 		 1493 bp  791    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.398256  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0013  16S ribosomal RNA  83.11 
 
 		 1493 bp  823    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000116367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0060  16S ribosomal RNA  82.96 
 
 		 1493 bp  807    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00434278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0021  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1551 bp  620  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.184479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0005  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1551 bp  620  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.872751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0058  16S ribosomal RNA  84.23 
 
 		 1543 bp  618  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0073  16S ribosomal RNA  84.23 
 
 		 1543 bp  618  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0018  16S ribosomal RNA  84.23 
 
 		 1543 bp  618  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0063  16S ribosomal RNA  84.23 
 
 		 1543 bp  618  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1563 bp  615  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1551 bp  613  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1551 bp  613  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1551 bp  613  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  83.91 
 
 		 1551 bp  613  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  84.02 
 
 		 1563 bp  615  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 1491 bp  601  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  83.78 
 
 		 1491 bp  601  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 1545 bp  595  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 1545 bp  595  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 1550 bp  595  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 1550 bp  595  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 1542 bp  595  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 1542 bp  595  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 1548 bp  591  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  83.82 
 
 		 1548 bp  591  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0033  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1548 bp  585  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0343433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0018  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1548 bp  585  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0028  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1548 bp  585  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000495274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0074  16S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 1548 bp  585  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0032  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1550 bp  573  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0577345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0043  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1550 bp  573  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1532 bp  565  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1532 bp  565  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1548 bp  551  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1548 bp  551  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  82.65 
 
 		 1538 bp  547  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0009  16S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 1538 bp  531  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000955328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  82.42 
 
 		 1526 bp  507  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  82.44 
 
 		 1535 bp  502  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0007  16S ribosomal RNA  83.99 
 
 		 1528 bp  502  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  82.44 
 
 		 1535 bp  502  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0011  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1542 bp  490  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0073  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1542 bp  490  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  86.45 
 
 		 1473 bp  488  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  86.45 
 
 		 1473 bp  488  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5677  16S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 1509 bp  488  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5289  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0602543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5007  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5688  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5642  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0485658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4582  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00856308  normal  0.0343893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5019  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.03826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0184  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1508 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000878132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5623  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00151087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5675  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5685  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.137206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0052  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1525 bp  480  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00180214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-2  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5013  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5822  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5313  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5231  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  hitchhiker  0.0000000000104089 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-8  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4781  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00045189  hitchhiker  0.000000313025 
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0031  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1508 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000247217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0007  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0347  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0567858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5616  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.162347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0849  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000507792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5630  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0540044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5682  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_1  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_10  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5722  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0170559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4997  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.544547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4991  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0475549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0208  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000398584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_5  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1510 bp  480  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5152  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000400545  hitchhiker  0.00430273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5703  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5647  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.227305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5694  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0644845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SB  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1507 bp  480  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00333572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0324  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1508 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000098756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0104  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1508 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000984323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0356  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0079994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5038  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000228353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba16SH  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1507 bp  480  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0595  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1508 bp  480  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5041  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1509 bp  480  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000406275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>