53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0034 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0034  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0063  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0002  tRNA-Lys  87.3 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0011  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0047  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.787632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0025  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0058  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0009  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.66226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0054  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122077 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  87.04 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0037  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000296875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0020  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.255497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.617808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0027  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0010  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0550905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0037  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0084  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0001  tRNA-Lys  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0022  tRNA-Met  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t30  tRNA-Met  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00107522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0052  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.274445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0010  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0056  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0032  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0031  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167609  hitchhiker  0.00292997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0029  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379837  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0045  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t36  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0047  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0072652  decreased coverage  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0052  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000241961  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0042  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00104158  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0042  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000336952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>