83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2382 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  100 
 
 
1161 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  100 
 
 
1173 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  100 
 
 
1116 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2662    99.91 
 
 
1061 bp  2089    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0117088  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2527    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  100 
 
 
1137 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  100 
 
 
1095 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  100 
 
 
1173 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  100 
 
 
1101 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2382    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2349    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.403799  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  100 
 
 
1089 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2296    100 
 
 
1071 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2295    100 
 
 
2273 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930273  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2210    100 
 
 
1065 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124453  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  100 
 
 
1095 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  100 
 
 
1098 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  100 
 
 
1083 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  100 
 
 
1083 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  100 
 
 
1158 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  100 
 
 
1152 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  100 
 
 
1077 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  100 
 
 
1089 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3514  hypothetical protein  100 
 
 
933 bp  1762    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  100 
 
 
1095 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3369  TROVE domain protein  100 
 
 
1080 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  100 
 
 
1086 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3181  Integrase catalytic region  100 
 
 
1089 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.299267  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  100 
 
 
1122 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  100 
 
 
1071 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3094    99.91 
 
 
1062 bp  2097    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0795639  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1806  Integrase catalytic region  99.9 
 
 
1011 bp  1988    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  100 
 
 
1116 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  100 
 
 
1071 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2964  Integrase catalytic region  100 
 
 
1071 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2913    100 
 
 
2281 bp  1935    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000174755  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  99.91 
 
 
1080 bp  2097    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2822    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.089488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  100 
 
 
1146 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  100 
 
 
1137 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  100 
 
 
1071 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  100 
 
 
1080 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0996    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.95785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  100 
 
 
1080 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  100 
 
 
1140 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  100 
 
 
1104 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0846    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  100 
 
 
1230 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  100 
 
 
1173 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  100 
 
 
1137 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  100 
 
 
1083 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0915    99.91 
 
 
1062 bp  2097    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0340134 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0634    100 
 
 
2234 bp  1590    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0587    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0165646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  100 
 
 
1116 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  100 
 
 
1296 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  100 
 
 
1122 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  100 
 
 
1125 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  100 
 
 
1236 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  99.91 
 
 
1095 bp  2097    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  100 
 
 
1158 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  100 
 
 
1131 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  99.91 
 
 
1137 bp  2097    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1734    99.81 
 
 
1067 bp  2077    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0811268  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  100 
 
 
1095 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  100 
 
 
1077 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1606    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0759753  normal  0.0212806 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  100 
 
 
1137 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  100 
 
 
1071 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  100 
 
 
1068 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  100 
 
 
1110 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  100 
 
 
1086 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  100 
 
 
1140 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1322    100 
 
 
1068 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1251    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  100 
 
 
1137 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  100 
 
 
1140 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  100 
 
 
1077 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1156    100 
 
 
1062 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.524803  hitchhiker  0.00604328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  100 
 
 
1137 bp  2105    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3516    100 
 
 
117 bp  202  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  89.71 
 
 
1050 bp  79.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 
1080 bp  48.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>