12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1402 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2357  ATP-dependent nuclease subunit B  57.56 
 
 		 778 aa  800    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.449533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 769 aa  1508    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.024307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.19 
 
 		 1146 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 684 aa  47.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.29 
 
 		 664 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 462 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  28.32 
 
 		 735 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1856  ATP-dependent nuclease subunit B  23.57 
 
 		 1186 aa  45.8  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.274018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1120  ATP-dependent DNA helicase  22.08 
 
 		 688 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  22.83 
 
 		 664 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 807 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.59 
 
 		 742 aa  44.3  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>