12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0033 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 		 107 bp  212  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0031  tRNA-OTHER  89.81 
 
 		 106 bp  113  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.368519 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0054  tRNA-Tyr  88.79 
 
 		 105 bp  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0051  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 111 bp  91.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000231354  decreased coverage  0.00000000261131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0053  tRNA-Tyr  85.05 
 
 		 106 bp  77.8  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0031  tRNA-Tyr  95.12 
 
 		 109 bp  60  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00928668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0030  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0028  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0011  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0010  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0037  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264586  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t65  tRNA-Tyr  96.3 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000604758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>