15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1081 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1081  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1825  hypothetical protein  57.3 
 
 
186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1449  Fe-S cluster domain-containing protein  56.59 
 
 
186 aa  209  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0158204  normal  0.046981 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0931  hypothetical protein  55.06 
 
 
195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.148155  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1130  hypothetical protein  53.89 
 
 
185 aa  195  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136033  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2500  hypothetical protein  51.4 
 
 
185 aa  193  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120376  normal  0.416305 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0970  ferredoxin domain-containing protein  52.27 
 
 
171 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1691  Protein of unknown function DUF2148  51.72 
 
 
174 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1023  hypothetical protein  50.28 
 
 
174 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00017517  unclonable  0.00000000437518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2606  hypothetical protein  45.56 
 
 
192 aa  148  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0714657  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0098  hypothetical protein  42.22 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1498  ferredoxin domain-containing protein  44.51 
 
 
161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.69084e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2899  conserved ferredoxin domain protein  39.01 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2806  hypothetical protein  37.95 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0095  hypothetical protein  38.68 
 
 
113 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000777984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>